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Enregistrement W3101750109

The transcriptional regulation of intestinal epithelial development and adenomatous polyposis coli tumour suppressor gene expression by Dlx homeobox genes

2011· dissertation· en· W3101750109 sur OpenAlexaboutno aff
Mario Fonseca

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2011
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomeoboxHomeobox A1SuppressorAdenomatous polyposis coliGeneCancer researchBiologyTumor suppressor geneCDX2GeneticsGene expressionColorectal cancerCancerCarcinogenesis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Colorectal cancer (CRC) is the fourth-most common cancer in Canada with a high mortality rate. Familial adenomatous polyposis (FAP) is a hereditary form of CRC; FAP patients carry germline mutations of the tumour suppressor gene adenomatous polyposis coli (APC). The function of Dlx genes in the gastrointestinal tract (GIT) has not been previously explored. Methods: Immunofluorescence (IF) was performed to identify Dlx2+ intestinal cells. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) was performed to identify DLX2-Apc promoter interaction. Quantitative real time polymerase chain reaction (qRT-PCR) was performed on mouse small and large intestines (normal and Dlx1/Dlx2 mutant mice). Electrophoretic mobility shift assays (EMSA) and reporter assays were carried out to investigate direct binding and activity, respectively, of DLX2 on the Apc promoter in-vitro. Dlx2 expression was explored in ApcMIN mice and human CRC tumor specimens. Results: Dlx2 is highly expressed in mouse embryonic and adult intestinal epithelia. Moreover, Dlx2 is expressed in the ApcMIN mice GIT as well as in some human CRC tumor specimens. ChIP, EMSA and reporter gene assays demonstrated that DLX2 protein specifically interacts with the Apc promoter in-situ and activates its expression in vitro. In-vivo and in-vitro, β-catenin protein levels are increased when DLX2 is absent or reduced by shRNA to Dlx2. Conclusions: Regulation of APC expression during development is poorly understood. We have evidence that DLX2 interacts with the Apc promoter in-vivo. We have shown that DLX2 induces Apc transcription by directly binding to the Apc promoter in-vitro. We also showed that β-catenin expression is altered in the Dlx1/Dlx2 mutant GIT. This finding implicates the involvement of DLX2 in the canonical Wnt signalling pathway. Ultimately, restoring APC expression may be a novel strategy towards preventing progression of intestinal polyps to adenocarcinoma. This research will contribute to our knowledge of the genetic and epigenetic regulatory pathways that control intestinal development, mucosal self-renewal and CRC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,262
Score d'incertitude au seuil0,682

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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