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Enregistrement W3101922324 · doi:10.21769/bioprotoc.3824

Rapid Isolation and Purification of Secreted Bacteriocins from Streptococcus mutans and Other Lactic Acid Bacteria

2020· article· en· W3101922324 sur OpenAlexafffund
Siew‐Ging Gong, Céline M. Lévesque

Notice bibliographique

RevueBIO-PROTOCOL · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBacteriocinBacteriaStreptococcus mutansMicrobiologyLactic acidLactococcusBiologyLantibioticsAntimicrobialLactococcus lactisAntimicrobial peptidesBiochemistryChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteriocins are small ribosomally synthesized antimicrobial peptides produced by some microorganisms including lactic acid bacteria (LAB), a group of Gram-positive bacteria (cocci, rods) expressing high tolerance for low pH.Bacteriocins kill bacteria rapidly and are biologically active at very low concentrations.Bacteriocins produced by LAB are primarily active against closely related bacterial species.Many bacteriocins have been investigated with respect to their potential use in promoting human, plant, and animal health, and as food biopreservatives.Bacteriocins produced by LAB are particularly interesting since several LAB have been granted GRAS (Generally Recognized as Safe) status.Because it is not always possible to extract active bacteriocins secreted from cells grown in liquid medium, we developed a simple and inexpensive peptide extraction procedure using a semi-solid nutrient-rich agar medium.We hereby present a detailed procedure that leads to the rapid extraction of secreted bioactive bacteriocin peptides from the oral species Streptococcus mutans, a prolific bacteriocin-producing species, and its potential application for bacteriocin extraction from other LAB (e.g., Streptococcus, Lactococcus, Enterococcus).We also present a simple method for the detection of bacteriocin activity from the purified extracellular peptide extract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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