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Enregistrement W3102119239 · doi:10.3390/ijms21228492

Genome-Wide Identification and Expression Analysis of Udp-Glucuronosyltransferases in the Whitefly Bemisia Tabaci (Gennadius) (HemipterA: Aleyrodidae)

2020· article· en· W3102119239 sur OpenAlexaff
Litao Guo, Wen Xie, Zezhong Yang, Jianping Xu, Youjun Zhang

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesAgricultural Science and Technology Innovation ProgramChinese Academy of Agricultural SciencesNatural Science Foundation of Hunan ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésWhiteflyBiologyHemipteraGeneHost adaptationPEST analysisAdaptation (eye)Brown planthopperHost (biology)RNA interferenceGeneticsGenomeFecundityRNA silencingBotanyRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bemisia tabaci (Gennadius) (Hemiptera: Aleyrodidae) is an important agricultural pest worldwide. Uridine diphosphate (UDP)-glucuronosyltransferases (UGTs) are one of the largest and most ubiquitous groups of proteins. Because of their role in detoxification, insect UGTs are attracting increasing attention. In this study, we identified and analyzed UGT genes in B. tabaci MEAM1 to investigate their potential roles in host adaptation and reproductive capacity. Based on phylogenetic and structural analyses, we identified 76 UGT genes in the B. tabaci MEAM1 genome. RNA-seq and real-time quantitative PCR (RT-qPCR) revealed differential expression patterns of these genes at different developmental stages and in association with four host plants (cabbage, cucumber, cotton and tomato). RNA interference results of selected UGTs showed that, when UGT352A1, UGT352B1, and UGT354A1 were respectively silenced by feeding on dsRNA, the fecundity of B. tabaci MEAM1 was reduced, suggesting that the expressions of these three UGT genes in this species may be associated with host-related fecundity. Together, our results provide detailed UGTs data in B.tabaci and help guide future studies on the mechanisms of host adaptation by B.tabaci.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,836
Score d'incertitude au seuil0,140

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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