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Enregistrement W3102300687 · doi:10.1128/mbio.02329-20

The Transcription Factor SomA Synchronously Regulates Biofilm Formation and Cell Wall Homeostasis in <i>Aspergillus fumigatus</i>

2020· article· en· W3102300687 sur OpenAlexafffund
Yuan Chen, François Le Mauff, Yan Wang, Ruiyang Lu, Donald C. Sheppard, Ling Lü, Shizhu Zhang

Notice bibliographique

RevuemBio · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMcGill UniversityInstitute of Infection and ImmunityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNational Key Research and Development Program of ChinaCanadian Institutes of Health ResearchPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsProgram for Jiangsu Excellent Scientific and Technological Innovation TeamNational Natural Science Foundation of ChinaGovernment of Canada
Mots-clésBiofilmCell biologyTranscription factorBiologyCell wallAspergillus fumigatusSomaBiochemistryGeneMicrobiologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cell wall is essential for fungal viability and is absent from human hosts; thus, drugs disrupting cell wall biosynthesis have gained more attention. Caspofungin is a member of a new class of clinically approved echinocandin drugs to treat invasive aspergillosis by blocking β-1,3-glucan synthase, thus damaging the fungal cell wall. Here, we demonstrate that caspofungin and other cell wall stressors can induce galactosaminogalactan (GAG)-dependent biofilm formation in the human pathogen Aspergillus fumigatus . We further identified SomA as a master transcription factor playing a dual role in both biofilm formation and cell wall homeostasis. SomA plays this dual role by direct binding to a conserved motif upstream of GAG biosynthetic genes and genes involved in cell wall stress sensors, chitin synthases, and β-1,3-glucan synthase. Collectively, these findings reveal a transcriptional control pathway that integrates biofilm formation and cell wall homeostasis and suggest SomA as an attractive target for antifungal drug development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,590
Score d'incertitude au seuil0,326

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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