← Retour à la cohorte
Publisher Correction: A genomic catalog of Earth’s microbiomes
Stephen Nayfach, Simon Roux, R. Seshadri, Daniel Udwary, Neha Varghese, Frederik Schulz, Dongying Wu, David Páez-Espino, I-Min A. Chen, Marcel Huntemann, Krishna Palaniappan, Joshua Ladau, Supratim Mukherjee, T. B. K. Reddy, Torben Nielsen, Edward Kirton, José P. Faria, Janaka N. Edirisinghe, Christopher S. Henry, Sean P. Jungbluth, Dylan Chivian, Paramvir Dehal, Elisha M. Wood‐Charlson, Adam P. Arkin, Susannah G. Tringe, Axel Visel, Helena Abreu, Silvia G. Acinas, Eric Allen, Michelle A. Allen, Gary L. Andersen, Alexandre M. B. Anesio, Graeme T. Attwood, Viridiana Avila‐Magaña, Yacine Badis, Jake V. Bailey, Brett J. Baker, Petr Baldrián, Hazel A. Barton, David A. C. Beck, Eric D. Becraft, Harry R. Beller, J. Michael Beman, Rizlan Bernier‐Latmani, Timothy D. Berry, Anthony D. Bertagnolli, Stefan Bertilsson, Jennifer Bhatnagar, Jordan T. Bird, Sara E. Blumer‐Schuette, Brendan J. M. Bohannan, Mikayla A. Borton, Allyson Brady, Susan H. Brawley, Juliet Brodie, Steven D. Brown, Jennifer R. Brum, Andreas Brune, Donald A. Bryant, Alison Buchan, Daniel H. Buckley, Joy Buongiorno, Hinsby Cadillo‐Quiroz, Sean M. Caffrey, Ashley Campbell, Barbara J. Campbell, Stephanie Carr, JoLynn Carroll, S. Craig Cary, Anna M. Cates, Rose Ann Cattolico, Ricardo Cavicchioli, Ludmila Chistoserdova, Maureen L. Coleman, Philippe Constant, Jonathan M. Conway, Walter P. Mac Cormack, Sean A. Crowe, Byron C. Crump, Cameron R. Currie, Rebecca Daly, Vincent J. Denef, Stuart E. Denman, Adey Feleke Desta, Hebe M. Dionisi, Jeremy A. Dodsworth, Nina Dombrowski, Timothy J. Donohue, Mark Dopson, Timothy Driscoll, Peter F. Dunfield, Christopher L. Dupont, Katherine A. Dynarski, Virginia P. Edgcomb, Elizabeth A. Edwards, Mostafa S. Elshahed, Israel Figueroa, Beverly E. Flood, Nathaniel W. Fortney, Caroline S. Fortunato, Christopher Francis, Claire M. M. Gachon, Sarahi L. Garcia, María Consuelo Gazitúa, Terry J. Gentry, Lena Gerwick, Javad Gharechahi, Peter Girguis, John M. Gladden, Mary R. Gradoville, Stephen E. Grasby, Kelly Gravuer, Christen L. Grettenberger, Robert J. Gruninger, Jiarong Guo, Mussie Y. Habteselassie, Steven Hallam, Roland Hatzenpichler, Bela Hausmann, Terry C. Hazen, Brian P. Hedlund, Cynthia Henny, Lydie Herfort, Maria Hernandez, Olivia S. Hershey, Matthias Hess, Emily B. Hollister, Laura Hug, Dana E. Hunt, Janet Jansson, Jessica Jarett, Vitaly V. Kadnikov, Charlene N. Kelly, Robert M. Kelly, William J. Kelly, Cheryl A. Kerfeld, Jeffrey A. Kimbrel, Jonathan L. Klassen, Konstantinos T. Konstantinidis, Laura L. Lee, Wen‐Jun Li, Andrew J. Loder, Alexander Loy, Mariana Lozada, Barbara J. MacGregor, Cara Magnabosco, Aline Maria da Silva, R. Michael L. McKay, Katherine D. McMahon, Christopher S. McSweeney, Mónica Medina, Laura Meredith, Jessica E. Mizzi, Thomas Möck, Lily Momper, Mary Ann Moran, Connor Morgan‐Lang, Duane P. Moser, Gerard Muyzer, David D. Myrold, Maisie Nash, Camilla Nesbø, Anthony P. Neumann, Rebecca B. Neumann, Daniel R. Noguera, Trent R. Northen, Jeanette M. Norton, Brent Nowinski, Klaus Nüsslein, Michelle O’Malley, Rafael S. Oliveira, Valéria Maia de Oliveira, T. C. Onstott, Jay Osvatic, Yang Ouyang, Maria Pachiadaki, Jacob Parnell, Laila P. Partida‐Martínez, Kabir Peay, Dale A. Pelletier, Xuefeng Peng, Michael Pester, Jennifer Pett‐Ridge, Sari Peura, Petra Pjevac, Alvaro M. Plominsky, Anja Poehlein, Phillip B. Pope, Nikolai V. Ravin, Molly C. Redmond, Rebecca A. Reiss, Virginia I. Rich, Christian Rinke, Jorge L. Mazza Rodrigues, Karen Rossmassler, Joshua Sackett, Ghasem Hosseini Salekdeh, S. R. Saleska, Matthew Scarborough, Daniel P. Schachtman, Christopher W. Schadt, Matthew Schrenk, Alexander Sczyrba, Aditi Sengupta, João Carlos Setúbal, Ashley Shade, Christine Sharp, David H. Sherman, О. V. Shubenkova, Isabel Natalia Sierra-Garcia, Rachel L. Simister, Holly M. Simon, Sara Sjöling, Joan L. Slonczewski, Rafael Soares Correa de Souza, John R. Spear, James Stegen, Ramūnas Stepanauskas, Frank J. Stewart, Garret Suen, Matthew B. Sullivan, D. Y. Sumner, Brandon K. Swan, Wesley D. Swingley, Jonathan Tarn, Gordon T. Taylor, Hanno Teeling, Memory Tekere, Andreas Teske, Torsten Thomas, Cameron Thrash, James M. Tiedje, Claire S. Ting, Benjamin Tully, Gene W. Tyson, David L. Valentine, Marc W. Van Goethem, Jean S. VanderGheynst, Tobin J. Verbeke, John Vollmers, Aurèle Vuillemin, Nicholas B. Waldo, David A. Walsh, Bart C. Weimer, Thea Whitman, Paul W. J. J. van der Wielen, Michael J. Wilkins, Timothy J. Williams, Ben J. Woodcroft, Jamie Woolet, Kelly Wrighton, Jun Ye, Erica B. Young, Noha H. Youssef, Feiqiao Brian Yu, Т. I. Zemskaya, Ryan Ziels, Tanja Woyke, Nigel J. Mouncey, Natalia Ivanova, Nikos C. Kyrpides, Emiley A. Eloe‐Fadrosh
Notice bibliographique
RevueNature Biotechnology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensConcordia UniversityUniversity of WindsorUniversity of WaterlooGeological Survey of CanadaNatural Resources CanadaUniversity of CalgaryAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of British ColumbiaInstitut National de la Recherche ScientifiqueUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesLawrence Livermore National LaboratoryMikrobiologický Ústav, Akademie Věd České RepublikyAgriculture and Agri-Food CanadaSandia National LaboratoriesGreat Lakes Bioenergy Research CenterNatural Resources CanadaSchool of Life Sciences, Arizona State UniversityStockholms UniversitetCollege of Engineering, Michigan State UniversityAddis Ababa UniversityNorth Carolina State UniversityUniversity of WashingtonLinnéuniversitetetUniversidad de Buenos AiresOffice of ScienceMax-Planck-Institut für Terrestrische MikrobiologieAkademie Věd České RepublikyUniversität WienGeorgia Institute of TechnologyConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasBaqiyatallah University of Medical SciencesUniversity of TorontoUniversity of New South WalesDirectorate for Biological SciencesJoint Genome InstituteUniversity of OregonUniversity of WaikatoOregon State UniversityMontana State UniversityKoninklijk Nederlands Instituut voor Onderzoek der ZeeWest Virginia UniversityUniversity of California, San DiegoUniversity of MontanaUniversity of Arkansas for Medical SciencesPennsylvania State UniversityMichigan State UniversityMcMaster UniversityUniversity of California, DavisUniversity of AkronHarvard UniversityScience for Life LaboratoryUniversiteit UtrechtUniversity of MinnesotaOklahoma State UniversityAgResearchArizona State UniversityDivision of Ocean SciencesUniversity of Wisconsin-MadisonU.S. Department of EnergySveriges LantbruksuniversitetLembaga Ilmu Pengetahuan IndonesiaAarhus UniversitetOhio State UniversityClemson UniversityLouisiana State UniversityColorado State University
Mots-clésMicrobiomeComputational biologyEarth (classical element)BiologyWorld Wide WebData scienceComputer scienceGeneticsAstronomy
Résumé
An amendment to this paper has been published and can be accessed via a link at the top of the paper.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,640
Score d'incertitude au seuil0,998
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations26
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui