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Enregistrement W3102785656 · doi:10.1182/bloodadvances.2020002727

Genetic factors rather than blast reduction determine outcomes of allogeneic HCT in <i>BCR-ABL</i>–negative MPN in blast phase

2020· article· en· W3102785656 sur OpenAlexaff
Vikas Gupta, Theodore A. Kennedy, José‐Mario Capo‐Chichi, Soyoung Kim, Zhen‐Huan Hu, Edwin P. Alyea, Uday Popat, Ronald Sobecks, Bart L. Scott, Aaron T. Gerds, Rachel B. Salit, H. Joachim Deeg, Ryotara Nakamura, Wael Saber

Notice bibliographique

RevueBlood Advances · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMyeloproliferative Neoplasms: Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity Health NetworkPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésHazard ratioCumulative incidenceInternal medicineMedicineOncologyTransplantationIncidence (geometry)Proportional hazards modelGastroenterologyConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is a limited understanding of the clinical and molecular factors associated with outcomes of hematopoietic cell transplantation (HCT) in patients with BCR-ABL-negative myeloproliferative neoplasms in blast phase (MPN-BP). Using the Center for International Blood and Marrow Transplant Research database, we evaluated HCT outcomes in 177 patients with MPN-BP. Ninety-five (54%) had sufficient DNA for targeted next-generation sequencing of 49 genes clinically relevant in hematologic malignancies. At 5 years, overall survival (OS), cumulative incidence of relapse, and nonrelapse mortality of the study cohort was 18%, 61%, and 25%, respectively. In a multivariable model, poor-risk cytogenetics was associated with inferior OS (hazard ratio [HR], 1.71; 95% CI, 1.21-2.41) due to increased relapse (HR, 1.93; 95% CI, 1.32-2.82). Transplants using mobilized peripheral blood (PB) were associated with better OS (HR, 0.60; 95% CI, 0.38-0.96). No difference in outcomes was observed in patients undergoing HCT with PB/BM blasts <5% vs those with active leukemia. Among the 95 patients with molecular data, mutation of TP53, present in 23%, was the only genetic alteration associated with outcomes. In a multivariate model, TP53-mutant patients had inferior OS (HR, 1.99; 95% CI, 1.14-3.49) and increased incidence of relapse (HR, 2.59; 95% CI, 1.41-4.74). There were no differences in the spectrum of gene mutations, number of mutations, or variant allele frequency between patients undergoing HCT with PB/BM blasts <5% vs those with active leukemia. Genetic factors, namely cytogenetic alterations and TP53 mutation status, rather than degree of cytoreduction predict outcomes of HCT in MPN-BP. No meaningful benefit of conventional HCT was observed in patients with MPN-BP and mutated TP53.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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