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Enregistrement W3103131700 · doi:10.1136/jmedgenet-2020-107385

A complex DICER1 syndrome phenotype associated with a germline pathogenic variant affecting the RNase IIIa domain of DICER1

2020· article· en· W3103131700 sur OpenAlexaff
Emeli Pontén, Sofia Frisk, Fulya Taylan, Raquel Vaz, Sandra Wessman, Leanne de Kock, Niklas Pal, William D. Foulkes, Kristina Lagerstedt‐Robinson, Ann Nordgren

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCongenital Diaphragmatic Hernia Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesBertil Hållstens ForskningsstiftelseBarncancerfondenVetenskapsrådetRadiumhemmets ForskningsfonderCancerfonden
Mots-clésGeneticsBiologyGermlineGermline mutationMissense mutationSanger sequencingPhenotypeExome sequencingMutationCancer researchGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Germline pathogenic variants in DICER1 cause DICER1 syndrome, an autosomal dominant, pleiotropic tumour predisposition syndrome with variable expressivity and reduced penetrance for specific dysplastic and neoplastic lesions. Recently, a syndrome with the acronym GLOW ( G lobal developmental delay, L ung cysts, O vergrowth, W ilms tumour) was described in two children with mosaic missense mutations in hotspot residues of the DICER1 RNase IIIb domain. Methods Whole genome sequencing, exome sequencing, Sanger sequencing, digital PCR and a review of Wilms tumours with DICER1 RNase III domain mutations were performed. Results A de novo heterozygous c.4031C>T (p.S1344L) variant in the sequence encoding the RNase IIIa domain of DICER1 was detected. Clinical investigations revealed a phenotype that resembles the GLOW subphenotype of DICER1 syndrome. Conclusion The phenotypic overlap between patients with p.S1344L mutation and GLOW syndrome provide clinical support for recent discoveries that RNase IIIa-Ser1344 site mutations impede miRNA-5p biogenesis analogous to DICER1 hotspot mutations in the RNase IIIb domain. We show that an individual with a heterozygous germline p.S1344L mutation has a severe form of DICER1 syndrome (‘DICER1 syndrome plus’), with notable features of intellectual disability, macrocephaly, physical abnormalities, Wilms tumour and a well-differentiated fetal adenocarcinoma of the lung.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,712
Score d'incertitude au seuil0,530

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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