MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3103340426 · doi:10.1101/2020.11.17.20233106

Combined polygenic risk scores of different psychiatric traits predict general and specific psychopathology in childhood

2020· preprint· en· W3103340426 sur OpenAlexafffundabout
Alexander Neumann, Alexia Jolicoeur‐Martineau, Eszter Székely, Hannah Sallis, Kieran O’Donnel, Celia M.T. Greenwood, Robert D. Levitan, Michael J. Meaney, Ashley Wazana, Jonathan Evans, Henning Tiemeier

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHealth, Environment, Cognitive Aging
Établissements canadiensCentre for Addiction and Mental HealthDouglas Mental Health University InstituteMcGill UniversityUniversity of TorontoJewish General Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of BristolUniversity of TorontoErasmus Medisch CentrumMcGill UniversityEuropean CommissionMarch of Dimes Foundation
Mots-clésPsychopathologyNeuroticismChild psychopathologyClinical psychologyMedicinePsychiatryPopulationResearch Domain CriteriaPsychologyPersonality

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background Polygenic risk scores (PRSs) operationalize genetic propensity towards a particular mental disorder and hold promise as early predictors of psychopathology, but before a PRS can be used clinically, explanatory power must be increased and the specificity for a psychiatric domain established. To enable early detection it is crucial to study these psychometric properties in childhood. We examined whether PRSs associate more with general or with specific psychopathology in school-aged children. Additionally, we tested whether psychiatric PRSs can be combined into a multi-PRS score for improved performance. Methods We computed 16 PRSs based on GWASs of psychiatric phenotypes, but also neuroticism and cognitive ability, in mostly adult populations. Study participants were 9247 school-aged children from three population-based cohorts of the DREAM-BIG consortium: ALSPAC (UK), The Generation R Study (Netherlands) and MAVAN (Canada). We associated each PRS with general and specific psychopathology factors, derived from a bifactor model based on self-, parental-, teacher-, and observer reports. After fitting each PRS in separate models, we also tested a multi-PRS model, in which all PRSs are entered simultaneously as predictors of the general psychopathology factor. Results Seven PRSs were associated with the general psychopathology factor after multiple testing adjustment, two with specific externalizing and five with specific internalizing psychopathology. PRSs predicted general psychopathology independently of each other, with the exception of depression and depressive symptom PRSs. Most PRSs associated with a specific psychopathology domain, were also associated with general child psychopathology. Conclusions The results suggest that PRSs based on current GWASs of psychiatric phenotypes tend to be associated with general psychopathology, or both general and specific psychiatric domains, but not with one specific psychopathology domain only. Furthermore, PRSs can be combined to improve predictive ability. PRS users should therefore be conscious of non-specificity and consider using multiple PRSs simultaneously, when predicting psychiatric disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxivMême sujetHealth, Environment, Cognitive AgingTravaux en français237 207