Controlling Gene‐Silencing with Azobenzene‐Containing siRNAs (siRNAzos)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract This article contains the detailed biophysical characterization, biological testing, and photo‐switching protocols of azobenzene containing siRNAs (siRNAzos), which have photoswitchable properties that can be controlled with light. First, the siRNAzos are characterized by annealing the sense and anti‐sense strands together and then measuring the circular dichroism (CD) profile, and the melting temperatures ( T m ) of the duplexes. Second, the biological testing of the siRNAzos in cell culture is done to determine their gene silencing efficacy. Finally, their gene‐silencing activities are measured after exposure to ultraviolet (UV) light in order to inactivate the siRNAzo, and then broadband visible light, which re‐activates the siRNAzo. This inactivation/reactivation protocol can be done in real time, and is reversible and robust and can be performed multiple times on the same sample if desired. © 2020 Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1 : Bio‐physical characterization of siRNAzo duplexes Basic Protocol 2 : Evaluation of azobenzene gene‐silencing using Firefly Luciferase Basic Protocol 3 : Evaluation of azobenzene gene‐silencing using reverse transcriptase‐polymerase chain reaction (RT‐PCR)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».