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Enregistrement W3104598639 · doi:10.1101/2020.11.09.20227801

Effects of apolipoprotein B on the lifespan and risks of major disease including type 2 diabetes: a Mendelian randomization analysis using outcomes in first-degree relatives

2020· preprint· en· W3104598639 sur OpenAlexaff
Tom G. Richardson, Qin Wang, Eleanor Sanderson, Anubha Mahajan, Mark I McCarthy, Timothy M. Frayling, Mika Ala‐Korpela, Allan D. Sniderman, George Davey Smith, Michael V. Holmes

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesInnovative Medicines InitiativeNovo Nordisk FondenUniversity of BristolEuropean CommissionBritish Heart FoundationNational Institute for Health and Care ResearchUK Research and InnovationMedical Research CouncilNovo NordiskEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and Associations
Mots-clésMendelian randomizationApolipoprotein BFirst-degree relativesMedicineInternal medicineType 2 diabetesDiabetes mellitusEndocrinologyFamily historyGeneticsBiologyCholesterolGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Apolipoprotein B (apoB) is emerging as the lipoprotein entity that is critical for the role that lipoprotein lipids play in the aetiology of coronary heart disease (CHD). In this study, we explored effects of genetically-predicted apoB on endpoints in first-degree relatives. Methods Univariable Mendelian randomization (MR) used a weighted genetic instrument (229 SNPs) for apoB. For endpoints that apoB associated with at FDR <5%, multivariable MR analyses including genetic instruments for LDL-C and triglycerides. Estimates are inferred causal effects per 1-SD elevated lipoprotein trait (for apoB, 1-SD= 0.24 g/L). Replication of estimates for longevity and T2D was conducted using conventional two-sample MR using summary estimates from GWAS consortia. Findings Parents were less likely to be alive with 10.7 months of life lost in fathers (95%CI: 7.6, 13.9; FDR-adjusted P=4.0×10 −10 ) and 5.8 months of life lost in mothers (95%CI: 3.0, 8.52; FDR-adjusted P=1.7×10 −4 ) per 1-SD higher apoB in offspring. Effects strengthened to ∼2 yrs of life lost in multivariable MR and replicated in conventional two-sample MR (OR surviving to 90 th centile: 0.38; 95%CI: 0.22, 0.65). Genetically-elevated apoB caused higher risks of heart disease in all first-degree relatives and higher risk of stroke in mothers. Findings in first-degree relatives were replicated in two-sample multivariable MR which identified apoB to increase (OR 2.32; 95%CI: 1.49, 3.61) and LDL-C lower (OR 0.34; 95%CI: 0.21, 0.54) risk of T2D. Interpretation Higher apoB shortens the lifespan, and increases risks of heart disease and stroke. T2D effects may represent injurious effects of dyslipidaemia to pancreatic islets. Research in Context Evidence before this study Prior observational and Mendelian randomization studies have indicated that circulating concentrations of apoB are of critical importance to lipid-mediated atherogenesis, manifest as coronary heart disease. Added value of this study In this study, we explored the effects of genetically-predicted elevations in apoB on multiple endpoints occuring in first degree relatives including longevity and sought replication of findings using more conventional methods to exploit the statistical power from data available in large-scale GWAS consortia. We identified that apoB had a deleterious effect on longevity, shortening the lifespan by months to years. Furthermore, apoB caused higher risks of CHD and stroke in first degree relatives. Finally, apoB was identified to increase risk of T2D, in contradistinction to LDL-C which lowered risk of T2D, when employing multivairable MR methods. Implications of all the available evidence Our findings support apoB as being the major lipoprotein entity critical for CHD and stroke and extends this to identify higher apoB as negatively impacting longevity and increasing risk of T2D. These findings highlight the critical role of apoB in causing cardiometabolic disease, which collectively shortens the lifespan.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,038
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,041
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,202

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0380,041
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,008
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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