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Enregistrement W3104714975 · doi:10.1371/journal.pone.0242577

Prevalence and genetic variability of occult hepatitis B virus in a human immunodeficiency virus positive patient cohort in Gondar, Ethiopia

2020· article· en· W3104714975 sur OpenAlexafffund
Nishi H. Patel, Vanessa Meier‐Stephenson, Meaza Genetu, Debasu Damtie, Ebba Abate, Shitaye Alemu, Yetework Aleka, Guido van Marle, Kevin Fonseca, Carla S. Coffin, Tekalign Deressa

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensProvincial Laboratory of Public HealthAlberta Health ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesUniversity of GondarUniversity of Calgary
Mots-clésHBsAgMedicineHepatitis B virusInterquartile rangeHepatitis BInternal medicineGenotypeVirologyOccultImmunologyGastroenterologyVirusBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Occult hepatitis B (OHB) is a major concern in HIV infected patients as it associates with a high risk of HBV reactivation and disease progression. However, data on the prevalence of OHB among HIV positive patients in Ethiopia is lacking. This study aims to determine the prevalence of OHB in HBV/HIV co-infected patients from Gondar, Ethiopia. METHODS: A total of 308 consented HIV positive patients were recruited from the University of Gondar Teaching Hospital, Ethiopia. Clinical and demographic data of the participants were recorded. Plasma was tested for HBsAg and anti-HBc using commercial assays (Abbott Architect). In HBsAg negative anti-HBc positive patient samples, total DNA was isolated and amplified using nested PCR with primers specific to HBV polymerase, surface and pre-core/core regions, followed by Sanger sequencing and HBV mutational analysis using MEGA 7.0. RESULTS: Of the total study subjects, 62.7% were female, median age 38.4 years, interquartile range (IQR): 18-68, and 208 (67.5%) had lifestyle risk factors for HBV acquisition. Two hundred and ninety-one study subjects were HIV+/HBsAg-, out of which 115 (39.5%) were positive for anti-HBc. Occult hepatitis B was detected in 19.1% (22/115) of anti-HBc positive HIV patients. HBV genotype D was the predominant genotype (81%) among OHB positive patients. Mutations associated with HBV drug resistance, HBV reactivation, and HCC risk were detected in 23% (5/22), 14% (3/22) and 45.5% (10/22) of patients, respectively. CONCLUSION: This study found a high rate of occult hepatitis B in HIV patients. Further, high rates of mutations associated with HBV reactivation, drug resistance, and HCC risk were detected in these patients. These data highlighted the need for integrating OHB screening for proper management of liver diseases in HIV patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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