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Enregistrement W3105141008 · doi:10.1109/tmi.2021.3123461

Deep Interpretable Classification and Weakly-Supervised Segmentation of Histology Images via Max-Min Uncertainty

2021· article· en· W3105141008 sur OpenAlexafffund
Soufiane Belharbi, Jérôme Rony, José Dolz, Ismail Ben Ayed, Luke McCaffrey, Éric Granger

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on Medical Imaging · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCompute Canada
Mots-clésDiscriminative modelArtificial intelligencePattern recognition (psychology)Computer scienceSegmentationKullback–Leibler divergenceSupport vector machineRobustness (evolution)Contextual image classificationMachine learningImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Weakly-supervised learning (WSL) has recently triggered substantial interest as it mitigates the lack of pixel-wise annotations. Given global image labels, WSL methods yield pixel-level predictions (segmentations), which enable to interpret class predictions. Despite their recent success, mostly with natural images, such methods can face important challenges when the foreground and background regions have similar visual cues, yielding high false-positive rates in segmentations, as is the case in challenging histology images. WSL training is commonly driven by standard classification losses, which implicitly maximize model confidence, and locate the discriminative regions linked to classification decisions. Therefore, they lack mechanisms for modeling explicitly non-discriminative regions and reducing false-positive rates. We propose novel regularization terms, which enable the model to seek both non-discriminative and discriminative regions, while discouraging unbalanced segmentations. We introduce high uncertainty as a criterion to localize non-discriminative regions that do not affect classifier decision, and describe it with original Kullback-Leibler (KL) divergence losses evaluating the deviation of posterior predictions from the uniform distribution. Our KL terms encourage high uncertainty of the model when the latter inputs the latent non-discriminative regions. Our loss integrates: (i) a cross-entropy seeking a foreground, where model confidence about class prediction is high; (ii) a KL regularizer seeking a background, where model uncertainty is high; and (iii) log-barrier terms discouraging unbalanced segmentations. Comprehensive experiments and ablation studies over the public GlaS colon cancer data and a Camelyon16 patch-based benchmark for breast cancer show substantial improvements over state-of-the-art WSL methods, and confirm the effect of our new regularizers (our code is publicly available at https://github.com/sbelharbi/deep-wsl-histo-min-max-uncertainty).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,968
Score d'incertitude au seuil0,559

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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