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Enregistrement W3105261403 · doi:10.1152/ajplung.00437.2020

Dysregulation of endocytic machinery and ACE2 in small airways of smokers and COPD patients can augment their susceptibility to SARS-CoV-2 (COVID-19) infections

2020· article· en· W3105261403 sur OpenAlexaff
Mathew Suji Eapen, Wenying Lu, Tillie‐Louise Hackett, Gurpreet K. Singhera, Isobel E. Thompson, Kielan Darcy McAlinden, Ashutosh Hardikar, Heinrich C. Weber, Greg Haug, Peter Wark, Collin Chia, Sukhwinder Singh Sohal

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Lung Cellular and Molecular Physiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesRebecca L. Cooper Medical Research Foundation
Mots-clésCOPDEndocytic cycleMedicineImmunostainingImmunologyLymphangioleiomyomatosisCathepsin DLungInternal medicineImmunohistochemistryPathologyBiologyReceptorEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lungs of smokers and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are severely compromised and are susceptible to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) attack. The dangerous combination of enhanced SARS-CoV-2 attachment receptor protein ACE2 along with an increase in endocytic vacuoles will enable viral attachment, entry, and replication. The objective of the study was to identify the presence of SARS-CoV-2 host attachment receptor angiotensin-converting enzyme-2 (ACE2) along with endocytic vacuoles, early endosome antigen-1 (EEA1), late endosome marker RAB7, cathepsin-L, and lysosomal associated membrane protein-1 (LAMP-1) as lysosome markers in the airways of smokers and COPD patients. The study design was cross-sectional and involved lung resections from 39 patients in total, which included 19 patients with Global Initiative for Chronic Obstructive Lung Disease (GOLD) stage I or GOLD stage II COPD, of which 9 were current smokers with COPD (COPD-CS) and 10 were ex-smokers with COPD (COPD-ES), 10 were normal lung function smokers, and 10 were never-smoking normal controls. Immunostaining for ACE2, EEA1, RAB7, and cathepsin-L was done. A comparative description for ACE2, EEA1, RAB7, and cathepsin-L expression pattern is provided for the patient groups. Furthermore, staining intensity for LAMP-1 lysosomes was measured as the ratio of the LAMP-1-stained areas per total area of epithelium or subepithelium, using Image ProPlus v7.0 software. LAMP-1 expression showed a positive correlation to patient smoking history while in COPD LAMP-1 negatively correlated to lung function. The active presence of ACE2 protein along with endocytic vacuoles such as early/late endosomes and lysosomes in the small airways of smokers and COPD patients provides evidence that these patient groups could be more susceptible to COVID-19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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