Molecular basis for inhibition of adhesin-mediated bacterial-host interactions through a novel peptide-binding domain
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Modulation of protein-protein interactions (PPIs) with small-molecules is a promising conceptual approach in drug discovery. In the area of bacterial colonization, PPIs contribute to adhesin-mediated biofilm formation that cause most infections. However, the molecular basis underlying these adhesin-ligand interactions is largely unknown. The 1.5-MDa adhesion protein, MpIBP, uses a peptide-binding domain ( Mp PBD) to help its Antarctic bacterium form symbiotic biofilms on sea ice with microalgae such as diatoms. X-ray crystallography revealed Mp PBD uses Camdependent interactions to self-associate with a crystal symmetry mate via the C-terminal threonine-proline-aspartate sequence. Structure-guided optimization derived penta-peptide ligands that bound Mp PBD 1,000-fold more tightly, with affinities in the nano-molar range. These ligands act as potent antagonists to block Mp PBD from binding to the diatom cells. Since adhesins of some human pathogens contain peptide-binding module homologs of Mp PBD, this same conceptual approach could help develop ligand-based PPI modulators to disrupt harmful bacteria-host interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».