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Enregistrement W3105570926 · doi:10.1074/jbc.ra120.015037

Calmodulin binds and modulates K+-dependent Na+/Ca2+-exchanger isoform 4, NCKX4

2020· article· en· W3105570926 sur OpenAlexafffund
Stephanie Thibodeau, Weidong Yang, Sunita Sharma, Jonathan Lytton

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueBiochemical Analysis and Sensing Techniques
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCalmodulinHEK 293 cellsGene isoformMutantBiologyBiochemistryChemistryMolecular biologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The family of K + -dependent Na + /Ca 2+ -exchangers, NCKX, are important mediators of cellular Ca 2+ efflux, particularly in neurons associated with sensory transduction. The NCKX family comprises five proteins, NCKX1–5, each being the product of a different SLC24 gene. NCKX4 ( SLC24A4 ) has been found to have a critical role in termination and adaptation of visual and olfactory signals, melanocortin-dependent satiety signaling, and the maturation of dental enamel. To explore mechanisms that might influence the temporal control of NCKX4 activity, a yeast two-hybrid system was used to search for protein interaction partners. We identified calmodulin as a partner for NCKX4 and confirmed the interaction using glutathione-S-transferase fusion pull-down. Calmodulin binding to NCKX4 was demonstrated in extracts from mouse brain and in transfected HEK293 cells. Calmodulin bound in a Ca 2+ -dependent manner to a motif present in the central cytosolic loop of NCKX4 and was abolished by the double-mutant I328D/F334D. When cotransfected in HEK293 cells, calmodulin bound to NCKX4 under basal conditions and induced a ∼2.5-fold increase in NCKX4 abundance, but did not influence either cellular location or basal activity. When purinergic stimulation of NCKX4 was examined in these cells, coexpression of wild-type calmodulin, but not a Ca 2+ binding-deficient calmodulin mutant, suppressed NCKX4 activation in a time-dependent manner. We propose that Ca 2+ binding to calmodulin prepositioned on NCKX4 induces a slow conformational rearrangement that interferes with purinergic stimulation of the exchanger, possibly by obscuring T331, a previously identified potential protein kinase C site.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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