MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3105692689 · doi:10.1002/anie.202012444

Selection and Characterization of an RNA‐Cleaving DNAzyme Activated by <i>Legionella pneumophila</i>

2020· article· en· W3105692689 sur OpenAlexafffund
Meghan Rothenbroker, Erin M. McConnell, Jason Gu, Malene L. Urbanus, Sahar Esmaeili Samani, Alex W. Ensminger, Carlos D. M. Filipe, Yingfu Li

Notice bibliographique

RevueAngewandte Chemie International Edition · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDeoxyribozymeLegionella pneumophilaChemistryRNASelection (genetic algorithm)LegionellaMicrobiologyBiochemistryBiologyDNAGeneticsGeneBacteriaComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Legionella pneumophila is a deadly bacterial pathogen that has caused numerous Legionnaires' disease outbreaks, where cooling towers were the most common source of exposure. Bacterial culturing is used for L. pneumophila detection, but this method takes approximately 10 days to complete. In this work, an RNA-cleaving fluorogenic DNAzyme, named LP1, was isolated. Extensive characterization revealed that LP1 is reactive with multiple infectious isolates of L. pneumophila but inactive with 25 other common bacterial species. LP1 is likely activated by a protein target, capable of generating a detectable signal in the presence of as few as 10 colony-forming units of L. pneumophila, and able to maintain its activity in cooling tower water from diverse sources. Given that similar DNAzymes have been incorporated into many sensitive assays for bacterial detection, LP1 holds the potential for the development of biosensors for monitoring the contamination of L. pneumophila in exposure sources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,446

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAngewandte Chemie International EditionMême sujetLegionella and Acanthamoeba researchTravaux en français237 207