Structural basis of ligand selectivity by a bacterial adhesin lectin involved in multi- species biofilm formation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Carbohydrate recognition by lectins governs critical host-microbe interactions. MpPA14 lectin is a domain of a 1.5-MDa adhesin responsible for a symbiotic bacterium-diatom interaction in Antarctica. Here we show Mp PA14 binds various monosaccharides, with L-fucose and N-acetyl glucosamine being the strongest ligands (K d ~ 150 μM). High-resolution structures of Mp PA14 with 15 different sugars bound elucidated the molecular basis for the lectin’s apparent binding promiscuity but underlying selectivity. Mp PA14 mediates strong Ca 2+ -dependent interactions with the 3, 4 diols of L-fucopyranose and glucopyranoses, and binds other sugars via their specific minor isomers. Thus, Mp PA14 only binds polysaccharides like branched glucans and fucoidans with these free end-groups. Consistent with our findings, adhesion of Mp PA14 to diatom cells was selectively blocked by L-fucose, but not by N-acetyl galactosamine. With Mp PA14 lectin homologs present in adhesins of several pathogens, our work gives insight into an anti-adhesion strategy to block infection via ligand-based antagonists.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».