Revisiting the epidemiology of pertussis in Canada, 1924–2015: a literature review, evidence synthesis, and modeling study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Disease surveillance is central to the public health understanding of pertussis epidemiology. In Canada, public reporting practices have significantly changed over time, creating challenges in accurately characterizing pertussis epidemiology. Debate has emerged over whether pertussis resurged after the introduction of adsorbed pertussis vaccines (1981-1985), and if the incidence fell to its pre-1985 after the introduction of acellular pertussis vaccines (1997-1998). Here, we aim to assemble a unified picture of pertussis disease incidence in Canada. METHODS: Using publicly available pertussis surveillance reports, we collected, analyzed and presented Canadian pertussis data for the period (1924-2015), encompassing the pre-vaccine era, introduction of vaccine, changes to vaccine technology, and the introduction of booster doses. Information on age began to be reported since 1952, but age reporting practices (full, partial or no ages) have evolved over time, and varied across provinces/territories. For those cases reported without age each year, we impute an age distribution by assuming it follows that of the age-reported cases. RESULTS: Below the age of 20 years, the adjusted age-specific incidence from 1969 to 1988 is substantially higher than existing estimates. In children < 1 year, the incidence in some years was comparable to that during the 1988-1999 resurgence. CONCLUSIONS: The results presented here suggest that the surge in the average yearly incidence of pertussis that began in 1988 was weaker than previously inferred, and in contrary to the past findings, below age 5, the average yearly incidence of pertussis from 1999 to 2015 (when the incidence dropped again) has been lower than it was from 1969 to 1988.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,016 | 0,057 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,008 |
| Bibliométrie | 0,023 | 0,038 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,005 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».