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Enregistrement W3106619470 · doi:10.3201/eid2701.203448

Fatal Case of Chronic Jamestown Canyon Virus Encephalitis Diagnosed by Metagenomic Sequencing in Patient Receiving Rituximab

2020· article· en· W3106619470 sur OpenAlexaboutno aff
Isaac H. Solomon, Vijay Ganesh, Guixia Yu, Xian Ding Deng, Michael R. Wilson, Steve Miller, Tracey Milligan, Shibani S. Mukerji, Abigail Mathewson, Justin Linxweiler, Darlene Morse, Jana M. Ritter, J. Erin Staples, Holly R. Hughes, Carolyn V. Gould, Pardis C. Sabeti, Charles Y. Chiu, Anne Piantadosi

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeBroad InstituteCharles and Helen Schwab FoundationNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCenters for Disease Control and PreventionNational Institutes of Health
Mots-clésMetagenomicsVirologyRituximabEncephalitisMedicineVirusBiologyImmunologyAntibodyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

J amestown Canyon orthobunyavirus (JCV) is a neg- ative-sense RNA virus in the California serogroup. Its tripartite genome comprises small (nucleocapsid), medium (glycoprotein), and large (polymerase) segments. JCV is distributed throughout the United States and Canada and has been isolated from multiple mammals and mosquitoes (1,2). Most infections occur in adults, during the summer, and are asymptomatic, but manifestations can include fever and acute meningoencephalitis (2). Cerebrospinal fluid (CSF) typically shows a lymphocytic pleocytosis with elevated protein and normal glucose. Diagnosis is made by detection of JCV IgM in serum or CSF and confirmed by plaque-reduction neutralization testing to rule out cross-reactivity with other California serogroup viruses (3). Detection of viral RNA in human CSF has rarely been described, with viremia presumed to be of short duration, so reverse transcription PCR (RT-PCR) is not routinely used for diagnosis No specific treatments are available, although intravenous ribavirin has been reported to improve seizures (6). Because of the limited number of cases described, the full range of findings associated with JCV infection is unknown. No fatal cases were reported to the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) before 2017, and no autopsy reports have been published (7).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,329
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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