MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3106696756 · doi:10.3389/fmars.2020.579706

Hemolymph Proteomics and Gut Microbiota of Horseshoe Crabs Tachypleus tridentatus and Carcinoscorpius rotundicauda

2020· article· en· W3106696756 sur OpenAlexaff
Zhe Qu, Thomas C. N. Leung, Wenyan Nong, Ho Yin Yip, Ivy H. T. Lee, Siu Gin Cheung, Ngai Sai Ming, Wai Lok So, William G. Bendena, Stephen S. Tobe, Jerome H. L. Hui

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Marine Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVenomous Animal Envenomation and Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoQueen's University
Organismes subventionnairesChinese University of Hong Kong
Mots-clésHorseshoe crabBiologyHemolymphZoologyEcologyLimulusAnnelidEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Horseshoe crabs are a group of marine chelicerates that contain only four extant species, some of which are endangered. Their hemolymph has been widely used in medical applications for endotoxin detection. Nevertheless, there is limited information on the profiles of their hemolymph proteins and their gut microbial diversity. In this study, we performed the first detailed investigation of the hemolymph proteomics and gut microbiota of two Asian horseshoe crabs Tachypleus tridentatus and Carcinoscorpius rotundicauda . Among the identified proteins being cataloged in the juvenile and adult hemolymph, unexpectedly, sesquiterpenoid signaling pathway proteins including Heat shock protein 83 (HSP83), Chd64, and a juvenile hormone binding protein (JHBP) were revealed. This provides evidence for the presence of functional sesquiterpenoid hormonal systems in these marine chelicerates. consumption of certain horseshoe crab species often leads to tetrodotoxin poisoning and the horseshoe crab is thought to possess a tetrodotoxin resistance mechanism. As such, sodium channels were analyzed and found to have critical amino acid residues that are similar to the toxin resistant pufferfish sodium channels. The source of the toxin is unknown so we investigated the gut microbiota, and found that Clostridium and Vibrio were the most dominant bacteria in T. tridentatus and C. rotundicauda , respectively. Together, this study provides a framework for further understanding of sesquiterpenoids and gut microbiota of these marine chelicerates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,453
Score d'incertitude au seuil0,376

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Marine ScienceMême sujetVenomous Animal Envenomation and StudiesTravaux en français237 207