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Enregistrement W3106778032 · doi:10.2196/medinform.6924

Temporal Design Patterns for Digital Phenotype Cohort Selection in Critical Care: Systematic Literature Assessment and Qualitative Synthesis

2020· article· en· W3106778032 sur OpenAlexvenueno aff
Daniel Capurro, Mario Barbé, Claudio Daza, Josefa Santa María, Javier Trincado

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueElectronic Health Records Systems
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesComisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica
Mots-clésComputer scienceSelection (genetic algorithm)MedicineComputational biologyData scienceBiologyArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Inclusion criteria for observational studies frequently contain temporal entities and relations. The use of digital phenotypes to create cohorts in electronic health record-based observational studies requires rich functionality to capture these temporal entities and relations. However, such functionality is not usually available or requires complex database queries and specialized expertise to build them. OBJECTIVE: The purpose of this study is to systematically assess observational studies reported in critical care literature to capture design requirements and functionalities for a graphical temporal abstraction-based digital phenotyping tool. METHODS: We iteratively extracted attributes describing patients, interventions, and clinical outcomes. We qualitatively synthesized studies, identifying all temporal and nontemporal entities and relations. RESULTS: We extracted data from 28 primary studies and 367 temporal and nontemporal entities. We generated a synthesis of entities, relations, and design patterns. CONCLUSIONS: We report on the observed types of clinical temporal entities and their relations as well as design requirements for a temporal abstraction-based digital phenotyping system. The results can be used to inform the development of such a system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,265
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,467
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,735
Score d'incertitude au seuil0,906

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2650,467
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,005
Bibliométrie0,0330,024
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0070,008
Science ouverte0,0030,009
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,505
Écart entre enseignants0,410 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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