Helminth Regulation of the Colonic Microbiome: Implications for the Control of Colitis
Notice bibliographique
Résumé
The mammalian gut is a dynamic and complex organ composed of host cells, bacteria, fungi and viruses; while parasitic protozoa and helminths can be transient residents in the intestine. Through the advancements in high throughput sequencing, an increasing number of studies have catalogued taxonomic compositional changes in the gut microbiota following infection with parasitic helminths. However, the functional implications of such helminth-microbiota interactions on the host are not well understood, especially in the context of controlling inflammation. The McKay laboratory continuously demonstrates that mice infected with the rat tapeworm, Hymenolepis diminuta, are protected from dinitrobenzene sulfonic acid (DNBS)-induced colitis. My thesis seeks to determine if H. diminuta is dependent on the intestinal microbiota to protect from colonic inflammation and to determine the underlying mechanisms that are responsible for this anti-inflammatory event. Although H. diminuta does not require the microbiota to infect or be recognized/expelled by the murine host’s immune system, distinct compositional changes to the colonic microbiota occur during infection with H. diminuta. Removing microbes by using germ-free mice or disrupting the intestinal microbiota through broad-spectrum antibiotic use inhibits the anti-inflammatory mechanism of H. diminuta towards DNBS-colitis. In addition to characterizing the compositional shift in the intestinal microbiota of mice infected with H. diminuta, we demonstrated a significant increase in fecal short chain fatty acids (SCFA), in particular acetate and butyrate. Infecting free fatty receptor 2 (ffar2)-knockout mice with H. diminuta inhibited the beneficial effect towards DNBS, and in parallel to this, treating mice with neutralizing IL-10 antibodies also blocked the protective effect of H. diminuta when challenged with DNBS. Immunostaining for IL-10Rα demonstrated increased reactivity in colonic tissues of mice that were either treated with butyrate enemas or infected with H. diminuta, as compared to tissue from naive mice. The data in this thesis provides proof-of-principle evidence that H. diminuta modulates both the gut microbiota and the immune system of its host to protect from chemically induced colitis. Where the removal of these constituents, inhibits H. diminuta’s ability to protect the host from colitis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».