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Enregistrement W3107552929 · doi:10.1111/ene.14649

Novel variants broaden the phenotypic spectrum of <i>PLEKHG5</i>‐associated neuropathies

2020· article· en· W3107552929 sur OpenAlexaff
Zhongbo Chen, Reza Maroofian, A. Nazlı Başak, Leena Shingavi, Mert Karakaya, Stéphanie Efthymiou, Emil K. Gustavsson, Leyla Meier, Kiran Polavarapu, Seena Vengalil, Veeramani Preethish‐Kumar, Bevinahalli N. Nandeesh, Nalan Gökçe Güneş, Onur Akan, Fatma Candan, Bertold Schrank, Stephan Züchner, David Murphy, Mahima Kapoor, Mina Ryten, Brunhilde Wirth, Mary M. Reilly, Atchayaram Nalini, Henry Houlden, Payam Sarraf

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neurology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCenter for Molecular Medicine Cologne, University of CologneMedical Research CouncilKoç Üniversitesi Translasyonel Tıp Araştırma MerkeziDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésSpinal muscular atrophyMedicineExome sequencingAmyotrophic lateral sclerosisDiseaseGeneticsMissense mutationPhenotypeBioinformaticsPathologyGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Pathogenic variants in PLEKHG5 have been reported to date to be causative in three unrelated families with autosomal recessive intermediate Charcot-Marie-Tooth disease (CMT) and in one consanguineous family with spinal muscular atrophy (SMA). PLEKHG5 is known to be expressed in the human peripheral nervous system, and previous studies have shown its function in axon terminal autophagy of synaptic vesicles, lending support to its underlying pathogenetic mechanism. Despite this, there is limited knowledge of the clinical and genetic spectrum of disease. METHODS: We leverage the diagnostic utility of exome and genome sequencing and describe novel biallelic variants in PLEKHG5 in 13 individuals from nine unrelated families originating from four different countries. We compare our phenotypic and genotypic findings with a comprehensive review of cases previously described in the literature. RESULTS: We found that patients presented with variable disease severity at different ages of onset (8-25 years). In our cases, weakness usually started proximally, progressing distally, and can be associated with intermediate slow conduction velocities and minor clinical sensory involvement. We report three novel nonsense and four novel missense pathogenic variants associated with these PLEKHG5-associated neuropathies, which are phenotypically spinal muscular atrophy (SMA) or intermediate Charcot-Marie-Tooth disease. CONCLUSIONS: PLEKHG5-associated neuropathies should be considered as an important differential in non-5q SMAs even in the presence of mild sensory impairment and a candidate causative gene for a wide range of hereditary neuropathies. We present this series of cases to further the understanding of the phenotypic and molecular spectrum of PLEKHG5-associated diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,910
Score d'incertitude au seuil0,849

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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