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Enregistrement W3107688076 · doi:10.1111/jon.12814

SS‐Detect: Development and Validation of a New Strategy for Source‐Based Morphometry in Multiscanner Studies

2020· article· en· W3107688076 sur OpenAlexaff
Ruiyang Ge, Tyler Keeling, William G. Honer, Sophia Frangou, Fidel Vila‐Rodriguez

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroimaging · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Source-based morphometry(SBM) has been used in multicenter studies pooling magnetic resonance imaging data across different scanners to advance the reproducibility of neuroscience research. In the present study, we developed an analysis strategy for Scanner-Specific Detection (SS-Detect) of SBPs in multiscanner studies, and evaluated its performance relative to a conventional strategy. METHODS: In the first experiment, the SimTB toolbox was used to generate simulated datasets mimicking 20 different scanners with common and scanner-specific SBPs. In the second experiment, we generated one simulated SBP from empirical gray matter volume (GMV) datasets from two different scanners. Moreover, we applied two strategies to compare SBPs between schizophrenia patients' and healthy controls' GMV from two scanners. RESULTS: The outputs of the conventional strategy were limited to whole-sample-level results across all scanners; the outputs of SS-Detect included whole-sample-level and scanner-specific results. In the first simulation experiment, SS-Detect successfully estimated all simulated SBPs, including the common and scanner-specific SBPs, whereas the conventional strategy detected only some of the whole-sample SBPs. The second simulation experiment showed that both strategies could detect the simulated SBP. Quantitative evaluations of both experiments demonstrated greater accuracy of the SS-Detect in estimating spatial SBPs and subject-specific loading parameters. In the third experiment, SS-Detect detected more significant between-group SBPs, and these SBPs corresponded with the results from voxel-based morphometry analysis, suggesting that SS-Detect has higher sensitivity in detecting between-group differences. CONCLUSIONS: SS-Detect outperformed the conventional strategy and can be considered advantageous when SBM is applied to a multiscanner study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,197
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,148 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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