Nitrogen cycling in coastal sediment microbial communities with seasonally variable benthic nutrient fluxes
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Benthic microbial communities contribute to nitrogen (N) cycling in coastal ecosystems through taxon-specific processes such as anammox, nitrification and N-fixation and community attributed pathways such as denitrification. By measuring the total (DNA-based) and active (RNA-based) surface sediment microbial community composition and the abundance and activity profiles of key N-cycling genes in a semi-enclosed embayment—Port Phillip Bay (PPB), Australia—we show that although the total relative abundance of N-cycling taxa is comparatively lower close to estuary inputs (Hobsons Bay [HB]), the capacity for this community to perform diverse Ncycling processes is comparatively higher than in sediments isolated from inputs (Central PPB [CPPB]). In HB, seasonal structuring of the sediment microbial community occurred between spring and summer, co-occurring with decreases in the activity profiles of anammox bacteria and organic carbon content. No changes were detected in the activity profiles of nitrifiers or the community-based pathway denitrification. Although no seasonal structuring of the sediment microbial community occurred in CPPB, the activity profiles of key N-cycling genes displayed comparatively higher within-site variability. These results show that despite N-cycling taxa representing a smaller fraction of the total community composition in estuary impacted sediments (HB) these microbial communities consistently engage in N-cycling processes and that seasonal instability in the composition of this community is not reflective of changes in its capacity to cycle N through coupled nitrification-denitrification but potentially via changes within the anammox community.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle