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Enregistrement W3107824758 · doi:10.1186/s13643-020-01526-z

Detection of Fusobacterium nucleatum in feces and colorectal mucosa as a risk factor for colorectal cancer: a systematic review and meta-analysis

2020· review· en· W3107824758 sur OpenAlexafffundabout
Amal Idrissi Janati, Igor Karp, Claudie Laprise, Hisham Sabri, Elham Emami

Notice bibliographique

RevueSystematic Reviews · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOtolaryngology and Infectious Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityWestern UniversityUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéUniversité de Montréal
Mots-clésMedicineFusobacterium nucleatumColorectal cancerMeta-analysisFecesRisk factorInternal medicineGastroenterologyFusobacteriumOncologyCancerMicrobiologyBacteriaBacteroides

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is a major cause of cancer deaths worldwide. Accumulating evidence suggests a potentially important role of colorectal infection with Fusobacterium nucleatum (F. nucleatum) in colorectal carcinogenesis. We conducted a systematic review, including both a qualitative synthesis and a meta-analysis, to synthesize the evidence from the epidemiological literature on the association between F. nucleatum detection in the colon/rectum and CRC. METHODS: A systematic literature search of Ovid MEDLINE(R), Embase, Web of Science Core Collection, EBM Reviews-Cochrane Database of Systematic Reviews, and CINAHL Plus with Full Text was conducted using earliest inclusive dates up to 4 October 2020. Eligible studies were original, comparative observational studies that reported results on colorectal F. nucleatum detection and CRC. Two independent reviewers extracted the relevant information. Odds ratio (OR) estimates were pooled across studies using the random effects model. Newcastle-Ottawa scale was used to critically appraise study quality. RESULTS: Twenty-four studies were included in the systematic review, of which 12 were included in the meta-analysis. Studies investigated F. nucleatum in feces, colorectal tissue samples, or both. In most studies included in the systematic review, the load of F. nucleatum was higher, on average, in specimens from CRC patients than in those from CRC-free controls. Meta-analysis showed a positive association between F. nucleatum detection in colorectal specimens and CRC (OR = 8.3; 95% confidence interval (95% CI) 5.2 to 13.0). CONCLUSIONS: The results of this systematic review suggest that F. nucleatum in the colon/rectum is associated with CRC. SYSTEMATIC REVIEW REGISTRATION: This systematic review protocol has been registered with the International Prospective Register of Systematic Reviews (PROSPERO) on July 10, 2018 (registration number CRD42018095866).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,075

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0210,040
Bibliométrie0,0090,010
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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