The plasma lipidome of the Quaker parrot (Myiopsitta monachus)
Notice bibliographique
Résumé
Dyslipidemias and lipid-accumulation disorders are common in captive parrots, in particular in Quaker parrots. Currently available diagnostic tests only measure a fraction of blood lipids and have overall problematic cross-species applicability. Comprehensively analyzing lipids in the plasma of parrots is the first step to better understand their lipid metabolism in health and disease, as well as to explore new lipid biomarkers. The plasma lipidome of 12 Quaker parrots was investigated using UHPLC-MS/MS with both targeted and untargeted methods. Targeted methods on 6 replicates measured 432 lipids comprised of sterol, cholesterol ester, bile acid, fatty acid, acylcarnitine, glycerolipid, glycerophospholipid, and sphingolipid panels. For untargeted lipidomics, precursor ion mass-to-charge ratios were matched to corresponding lipids using the LIPIDMAPS structure database and LipidBlast at the sum composition or acyl species level of information. Sterol lipids and glycerophospholipids constituted the majority of plasma lipids on a molar basis. The most common lipids detected with the targeted methods included free cholesterol, CE(18:2), CE(20:4) for sterol lipids; PC(36:2), PC(34:2), PC(34:1) for glycerophospholipids; TG(52:3), TG(54:4), TG(54:5), TG(52:2) for glycerolipids; SM(d18:1/16:0) for sphingolipids; and palmitic acid for fatty acyls. Over a thousand different lipid species were detected by untargeted lipidomics. Sex differences in the plasma lipidome were observed using heatmaps, principal component analysis, and discriminant analysis. This report presents the first comprehensive database of plasma lipid species in psittacine birds and paves the way for further research into blood lipid diagnostics and the impact of diet, diseases, and drugs on the parrot plasma lipidome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».