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Enregistrement W3108093312 · doi:10.1002/edn3.165

Linking bacterial diversity to floral identity in the bumble bee pollen basket

2020· article· en· W3108093312 sur OpenAlexafffund
Nicholas Sookhan, A. Lorenzo, Shinichi Tatsumi, Mandy Yuen, J. Scott MacIvor

Notice bibliographique

RevueEnvironmental DNA · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyPollenPollinatorOperational taxonomic unitBotanyAlpha diversityBiodiversityEcologyPollinationBacteria16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Multitrophic interactions are ubiquitous in nature and form the basis of biodiversity. For example, bumble bees visit flowers to collect pollen, on which a variety of bacteria exist. Such bacteria consist of pathogens and mutualists and therefore have consequences for bumble bee colony fitness. However, we still know little about how plant diversity and floral selection by bees translate into the bacterial diversity and composition on the pollen consumed by important pollinators. The aim of this study was to characterize the bacterial and floral alpha and beta diversity from bumble bee corbicula (pollen baskets), identify core communities, and characterize their functional role. We found that bacterial alpha diversity (i.e., the diversity of bacteria determined from the pollen basket of a single bumble bee) was positively correlated with floral pollen alpha diversity (i.e., the diversity of plants from that same pollen basket). Bacterial beta diversity (i.e., bacterial composition) was generally weakly correlated with pollen beta diversity (i.e., floral composition). The abundance of some bacterial genera and pollen families was correlated, specifically Lactobacillus and Acinetobacter were positively correlated with Asteraceae pollen and negatively correlated with Lamiaceae pollen. The most widespread bacteria (the “core OTU”) in bumble bee pollen baskets included both possibly beneficial ( Lactobacillus ) and potentially pathogenic ( Pseudomonas ) taxa, but more core OTU functions were unknown vs. known for bumble bees, illustrating the importance of understanding bee–flower–microbe relationships in natural settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,688
Score d'incertitude au seuil0,566

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,150 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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