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Enregistrement W3108118156 · doi:10.1002/ana.25973

<scp><i>EIF2AK2</i></scp> Missense Variants Associated with Early Onset Generalized Dystonia

2020· article· en· W3108118156 sur OpenAlexaff
Demy J.S. Kuipers, Wim Mandemakers, Chin‐Song Lu, Simone Olgiati, Guido J. Breedveld, Christina Fevga, Vera Tadić, Miryam Carecchio, Bradley Osterman, Lena Sagi‐Dain, Yah‐Huei Wu‐Chou, Chiung C. Chen, Hsiu‐Chen Chang, Shey‐Lin Wu, Tu‐Hsueh Yeh, Yi‐Hsin Weng, Antonio Emanuele Elia, Celeste Panteghini, Nicolas Marotta, Martje G. Pauly, Andrea A. Kühn, Jens Volkmann, Baiba Lāce, Inge A. Meijer, Krishna Kumar Kandaswamy, Marialuisa Quadri, Barbara Garavaglia, Katja Lohmann, Peter Bauer, Niccolò E. Mencacci, Steven Lubbe, Christine Klein, Aida M. Bertoli‐Avella, Vincenzo Bonifati

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalCentre hospitalier universitaire de QuébecMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesDamp StiftungStichting ParkinsonFonds
Mots-clésMissense mutationProtein kinase RSanger sequencingBiologyDystoniaExome sequencingGeneticsCompound heterozygosityIntegrated stress responseGeneProtein kinase AKinaseMutationTranslation (biology)Messenger RNANeuroscienceCyclin-dependent kinase 2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: The study was undertaken to identify a monogenic cause of early onset, generalized dystonia. METHODS: Methods consisted of genome-wide linkage analysis, exome and Sanger sequencing, clinical neurological examination, brain magnetic resonance imaging, and protein expression studies in skin fibroblasts from patients. RESULTS: We identified a heterozygous variant, c.388G>A, p.Gly130Arg, in the eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 (EIF2AK2) gene, segregating with early onset isolated generalized dystonia in 5 patients of a Taiwanese family. EIF2AK2 sequencing in 191 unrelated patients with unexplained dystonia yielded 2 unrelated Caucasian patients with an identical heterozygous c.388G>A, p.Gly130Arg variant, occurring de novo in one case, another patient carrying a different heterozygous variant, c.413G>C, p.Gly138Ala, and one last patient, born from consanguineous parents, carrying a third, homozygous variant c.95A>C, p.Asn32Thr. These 3 missense variants are absent from gnomAD, and are located in functional domains of the encoded protein. In 3 patients, additional neurological manifestations were present, including intellectual disability and spasticity. EIF2AK2 encodes a kinase (protein kinase R [PKR]) that phosphorylates eukaryotic translation initiation factor 2 alpha (eIF2α), which orchestrates the cellular stress response. Our expression studies showed abnormally enhanced activation of the cellular stress response, monitored by PKR-mediated phosphorylation of eIF2α, in fibroblasts from patients with EIF2AK2 variants. Intriguingly, PKR can also be regulated by PRKRA (protein interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A), the product of another gene causing monogenic dystonia. INTERPRETATION: We identified EIF2AK2 variants implicated in early onset generalized dystonia, which can be dominantly or recessively inherited, or occur de novo. Our findings provide direct evidence for a key role of a dysfunctional eIF2α pathway in the pathogenesis of dystonia. ANN NEUROL 2021;89:485-497.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,716
Score d'incertitude au seuil0,613

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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