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Enregistrement W3108223648 · doi:10.1038/s41598-020-77446-8

Antiseptic quaternary ammonium compound tolerance by gram-negative bacteria can be rapidly detected using an impermeant fluorescent dye-based assay

2020· article· en· W3108223648 sur OpenAlexafffund
Branden S. J. Gregorchuk, Shelby L. Reimer, Daniel R. Beniac, Shannon L. Hiebert, Timothy F. Booth, Michelle Wuzinski, Brielle E. Funk, Kieran A. Milner, Nicola H. Cartwright, Ali N. Doucet, Michael R. Mulvey, Mazdak Khajehpour, George G. Zhanel, Denice C. Bay

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAntimicrobial agents and applications
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesResearch Manitoba
Mots-clésBiocidePropidium iodideBacteriaBroth microdilutionMicrobiologyFluorescenceAmmoniumMinimum inhibitory concentrationEscherichia coliAntimicrobialGram-negative bacteriaPseudomonas aeruginosaChemistryBiologyCetrimideBenzalkonium chlorideChromatographyBiochemistryApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biocides such as quaternary ammonium compounds (QACs) are potentially important contributors towards bacterial antimicrobial resistance development, however, their contributions are unclear due to a lack of internationally recognized biocide testing standards. Methods to detect QAC tolerance are limited to laborious traditional antimicrobial susceptibility testing (AST) methods. Here, we developed a rapid fluorescent dye-based membrane impermeant assay (RFDMIA) to discriminate QAC susceptibility among Gram-negative Enterobacterales and Pseudomonadales species. RFDMIA uses a membrane impermeant fluorescent dye, propidium iodide, in a 30-min 96-well fluorescent microplate-based assay where cell suspensions are exposed to increasing QAC concentrations. Our results demonstrate that RFDMIA can discriminate between QAC-susceptible and QAC-adapted Escherichia coli tolerant phenotypes and predict benzalkonium and cetrimide tolerance in all species tested except for intrinsically fluorescent Pseudomonas aeruginosa. RFDMIA identified a close association to minimum inhibitory concentration values determined by broth microdilution AST and increasing fluorescent dye emission values. RFDMIA emission values and scanning electron microscopy results also suggest that CET-adapted E. coli isolates have a CET dependence, where cells require sub-inhibitory CET concentrations to maintain bacilliform cell integrity. Overall, this study generates a new, rapid, sensitive fluorescent assay capable of detecting QAC-susceptible Gram-negative bacteria phenotypes and cell membrane perturbations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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