The Contrasting Role of Nasopharyngeal Angiotensin Converting Enzyme 2 ( <i>ACE2</i> ) Expression in SARS-CoV-2 Infection: A Cross-Sectional Study of People Tested for COVID-19 in British Columbia
Notice bibliographique
Résumé
Summary Background Angiotensin converting enzyme 2 ( ACE2 ) serves as the host receptor for SARS-CoV-2, with a critical role in viral infection. We aim to understand population level variation of nasopharyngeal ACE2 expression in people tested for COVID-19 and the relationship between ACE2 expression and SARS-CoV-2 viral RNA load, while adjusting for expression of the complementary protease, Transmembrane serine protease 2 ( TMPRSS2) , soluble ACE2 , age, and biological sex. Methods A cross-sectional study of n=424 participants aged 1-104 years referred for COVID-19 testing was performed in British Columbia, Canada. Participants who tested negative or positive for COVID-19 were matched by age and biological sex. Viral and host gene expression was measured by quantitative reverse-transcriptase polymerase chain reaction. Bivariate analysis and multiple linear regression were performed to understand the role of nasopharyngeal ACE2 expression in SARS-CoV-2 infection. The ACE2 gene was targeted to measure expression of transmembrane and soluble transcripts. Findings Analysis shows no association between age and nasopharyngeal ACE2 expression in those who tested negative for COVID-19 (P=0·092). Mean expression of transmembrane (P=1·2e-4), soluble ACE2 (P<0·0001) and TMPRSS2 (P<0·0001) differed between COVID-19-negative and -positive groups. In bivariate analysis of COVID-19-positive participants, expression of transmembrane ACE2 positively correlated with SARS-CoV-2 RNA viral load (P<0·0001), expression of soluble ACE2 negatively correlated (P<0·0001), and no correlation was found with TMPRSS2 (P= 0·694 ) . Multivariable analysis showed that the greatest viral RNA loads were observed in participants with high transmembrane ACE2 expression ( B =0·886, 95%CI:[0·596 to 1·18]), while expression of soluble ACE2 may protect against high viral RNA load in the upper respiratory tract ( B = −0·0990, 95%CI:[−0·176 to −0·0224]). Interpretation Nasopharyngeal ACE2 expression plays a dual, contrasting role in SARS-CoV-2 infection of the upper respiratory tract. Transmembrane ACE2 positively correlates, while soluble ACE2 negatively correlates with viral RNA load after adjusting for age, biological sex and expression of TMPRSS2. Funding This project (COV-55) was funded by Genome British Columbia as part of their COVID-19 rapid response initiative.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».