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Enregistrement W3108592815 · doi:10.1016/j.prevetmed.2020.105164

A cross-sectional study of the prevalence factors associated with fluoroquinolone resistant Campylobacter jejuni in broiler flocks in Canada

2020· article· en· W3108592815 sur OpenAlexafffundabout
Niamh Caffrey, Agnes Agunos, Sheryl Gow, Karen Liljebjelke, Cheryl Waldner, Chunu Mainali, Sylvia Checkley

Notice bibliographique

RevuePreventive Veterinary Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensAlberta Ministry of Agriculture and ForestryPublic Health Agency of CanadaUniversity of SaskatchewanUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAlberta Agriculture and Forestry
Mots-clésFlockCampylobacter jejuniCampylobacterCampylobacteriosisVeterinary medicineAntibiotic resistanceBroilerTetracyclineMedicineBiologyBarnEnvironmental healthAntibioticsMicrobiologyGeographyAnimal scienceBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter infections in humans are usually self-limiting; however, antibiotic intervention may be necessary in the case of severe infection. Fluoroquinolones are often the drug of choice for treatment of campylobacteriosis; however, resistance to these drugs can develop rapidly, complicating treatment protocols. Increasing resistance to fluoroquinolones in human infections has coincided with approval of use of fluoroquinolones in animals, therefore, isolation of fluoroquinolone resistant (FQr) Campylobacter in broiler flocks is concerning. This cross-sectional study utilized data collected from 2013-2018 by the Canadian Integrated Program for Antimicrobial Resistance Surveillance (CIPARS) on-farm surveillance program to investigate prevalence factors associated with the isolation of FQr C. jejuni from broiler faecal samples. Mixed effects logistic regression models accounting for clustering of flocks within hatcheries, with and without a fixed effect for the presence of flock level tetracycline resistance were used to assess prevalence factors among 536 C. jejuni isolates from 158 flocks. Both models indicated that the type of bird used (Ross versus Cobb or mixed), the use of virginiamycin as a feed additive, the use of traps to control rodent populations in the barn, and the total number of birds in the barn were significant prevalence factors for increased FQr C. jejuni in a flock. In the model where flock level tetracycline resistance was included as a fixed effect, the odds of FQr C. jejuni increased by 16 (95% CI: 3.74, 68), and the magnitude of the effect of each of the identified prevalence factors was larger. Both models indicated that methods of disinfection of water lines between production cycles is important, with the use of chlorine being protective in the model where tetracycline resistance was included as a fixed effect, and the use of hydrogen peroxide being a risk factor in the model where tetracycline resistance was not included as a fixed effect. The use of hot water to wash the barn between production cycles was also a significant protective factor in the model where tetracycline resistance was not included as a fixed effect. These results indicate that biosecurity and sanitation procedures play a role in the dissemination of FQr C. jejuni in broiler flocks. Future analysis should seek to understand the effect of different disinfectant products on the isolation of FQr C. jejuni. Gaining a better understanding of the management of these critical practices may allow for the reduction of this enteric pathogen in broiler flocks in Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,329
Score d'incertitude au seuil0,665

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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