Integration of meta-QTL discovery with omics: Towards a molecular breeding platform for improving wheat resistance to Fusarium head blight
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium head blight (FHB) is a global wheat disease that devastates wheat production. Resistance to FHB spread within a wheat spike (type II resistance) and to mycotoxin accumulation in infected kernel (type III resistance) are the two main types of resistance. Of hundreds of QTL that have been reported, only a few can be used in wheat breeding because most show minor and/or inconsistent effects in different genetic backgrounds. We describe a new strategy for identifying robust and reliable meta-QTL (mQTL) that can be used for improvement of wheat FHB resistance. It involves integration of mQTL analysis with mQTL physical mapping and identification of single-copy markers and candidate genes. Using meta-analysis, we consolidated 625 original QTL from 113 publications into 118 genetic map-based mQTL (gmQTL). These gmQTL were further located on the Chinese Spring reference sequence map. Finally, 77 high-confidence mQTL (hcmQTL) were selected from the reference sequence-based mQTL (smQTL). Locus-specific single nucleotide polymorphism (SNP) and simple sequence repeat (SSR) markers and 17 genes responsive to FHB were then identified in the hcmQTL intervals by combined analysis of transcriptomic and proteomic data. This work may lead to a comprehensive molecular breeding platform for improving wheat resistance to FHB.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle