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Enregistrement W3108913671 · doi:10.3354/dao03554

Detection of Myxobolus cerebralis (Bivalvulida: Myxobolidae) in two non-Tubifex tubifex oligochaetes in the southeastern USA

2020· article· en· W3108913671 sur OpenAlexaff
SP Ksepka, JM Rash, Wenlong Cai, Stephen A. Bullard

Notice bibliographique

RevueDiseases of Aquatic Organisms · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMyxozoan Parasites in Aquatic Species
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTubifex tubifexTubifexBiologyMyxobolusZoologyEcologyMyxozoaOligochaeta (plant)Sister groupPhylogenetic treeCladeFisheryFish <Actinopterygii>GeneticsGill

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myxobolus cerebralis (Hofer, 1903), the etiological agent of salmonid whirling disease, reportedly matures in only the oligochaete 'Tubifex tubifex'. The concept of 'T. tubifex' is problematic because it is renowned as a species complex (or having 'strains'), and many sequences ascribed to this taxon in GenBank are misidentified or indicate several cryptic species. These facts cast doubt on the long-held notion that M. cerebralis is strictly host-specific to the single definitive host, T. tubifex. Herein, as part of an ongoing regional whirling disease monitoring project, oligochaetes (452 specimens) were collected from 31 riverine sites in western North Carolina (August through September 2015) and screened for infection by M. cerebralis. The species-specific nested PCR for M. cerebralis was positive for 8 oligochaete specimens from the French Broad River Basin (Mill Creek and Watauga River) and New River Basin (Big Horse Creek). We individually barcoded these M. cerebralis-positive oligochaete specimens using cytochrome oxidase 1 (CO1) primers and then conducted a Bayesian inference phylogenetic analysis. We identified 2 oligochaete genotypes: one sister to a clade comprising Limnodrilus udekemianus (Haplotaxida: Naididae) and another sister to Limnodrilus hoffmeisteri. This is the first detection of M. cerebralis from an oligochaete in the SE USA and the first detection of M. cerebralis from an oligochaete other than T. tubifex. These results suggest that other non-T. tubifex definitive hosts can harbor the pathogen and should be considered in the context of fish hatchery biosecurity and monitoring wild trout streams for M. cerebralis and whirling disease in the southeastern USA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,190
Score d'incertitude au seuil0,908

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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