Detection of Myxobolus cerebralis (Bivalvulida: Myxobolidae) in two non-Tubifex tubifex oligochaetes in the southeastern USA
Notice bibliographique
Résumé
Myxobolus cerebralis (Hofer, 1903), the etiological agent of salmonid whirling disease, reportedly matures in only the oligochaete 'Tubifex tubifex'. The concept of 'T. tubifex' is problematic because it is renowned as a species complex (or having 'strains'), and many sequences ascribed to this taxon in GenBank are misidentified or indicate several cryptic species. These facts cast doubt on the long-held notion that M. cerebralis is strictly host-specific to the single definitive host, T. tubifex. Herein, as part of an ongoing regional whirling disease monitoring project, oligochaetes (452 specimens) were collected from 31 riverine sites in western North Carolina (August through September 2015) and screened for infection by M. cerebralis. The species-specific nested PCR for M. cerebralis was positive for 8 oligochaete specimens from the French Broad River Basin (Mill Creek and Watauga River) and New River Basin (Big Horse Creek). We individually barcoded these M. cerebralis-positive oligochaete specimens using cytochrome oxidase 1 (CO1) primers and then conducted a Bayesian inference phylogenetic analysis. We identified 2 oligochaete genotypes: one sister to a clade comprising Limnodrilus udekemianus (Haplotaxida: Naididae) and another sister to Limnodrilus hoffmeisteri. This is the first detection of M. cerebralis from an oligochaete in the SE USA and the first detection of M. cerebralis from an oligochaete other than T. tubifex. These results suggest that other non-T. tubifex definitive hosts can harbor the pathogen and should be considered in the context of fish hatchery biosecurity and monitoring wild trout streams for M. cerebralis and whirling disease in the southeastern USA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».