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Enregistrement W3109102587 · doi:10.1155/2020/2895276

The Importance of Cancer Registry Linkage for Studying Rare Cancers in Prospective Cohorts

2020· article· en· W3109102587 sur OpenAlexafffundabout
Emily Maplethorpe, Emily Walker, Trenton Smith, Faith G. Davis, Yan Yuan

Notice bibliographique

RevueJournal of Cancer Epidemiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Cancer FoundationCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaPartenariat Canadien Contre Le CancerNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Health Services
Mots-clésCancerLinkage (software)Record linkageCancer registryComputational biologyMedicineOncologyBiologyInternal medicineGeneticsEnvironmental healthGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Large prospective cohort studies may offer an opportunity to study the etiology and natural history of rare cancers. Cancer diagnoses in observational cohort studies are often self-reported. Little information exists on the validity of self-reported cancer diagnosis, especially rare cancers, in Canada. This study evaluated the validity of self-reported cancer diagnosis in Alberta's Tomorrow Project (ATP), a provincial cohort in Canada. ATP data were linked to the Alberta Cancer Registry (ACR). The first instance of self-reported cancer in a follow-up survey was compared to the first cancer diagnosis in the ACR after enrollment. The sensitivity and positive predictive value (PPV) were estimated for the reporting of cancer status, reporting of common or rare cancer, and reporting of site-specific cancer. Logistic regression analysis explored factors associated with false positive, false negative, and incorrect cancer site reporting. In the 30,843 ATP participants who consented to registry linkage, there were 810 primary cancer diagnoses in the ACR and 959 self-reports of first cancer post-enrollment, for a cancer status sensitivity of 92.1% (95% CI: 90.0-93.9) and PPV of 77.8% (95% CI: 75.0-80.4). Compared to common cancers, rare cancers had a lower sensitivity (62.8% vs. 89.6%) and PPV (35.8% vs. 84.5%). Participants with a rare cancer were more likely to report an incorrect site than those with a common cancer. Rare cancers were less likely to be captured by active follow-up than common cancers. While rare cancer research may be feasible in large cohort studies, registry linkage is necessary to capture rare cancer diagnoses completely and accurately.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,317
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,460
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,317
Score d'incertitude au seuil0,842

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3170,460
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0060,012
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0040,005
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,120
Tête enseignante GPT0,467
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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