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Enregistrement W3109167769 · doi:10.1101/2020.11.27.401521

Phytochrome contributes to blue-light-mediated stem elongation and associated shade-avoidance response in mature <i>Arabidopsis</i> plants

2020· preprint· en· W3109167769 sur OpenAlexafffund
Yun Kong, Youbin Zheng

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLight effects on plants
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPhytochromeBlue lightShade avoidanceElongationArabidopsisMutantPhytochrome AWild typeBotanyPhotosynthesisFar-redArabidopsis thalianaBiophysicsOrnamental plantBiologyChemistryRed lightBiochemistryPhysicsMaterials scienceOpticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Our recent studies on ornamental plants and microgreens indicate that blue-light-mediated stem elongation is related to phytochrome activity, which was based on the calculated phytochrome photoequilibrium. To examine whether phytochromes really contribute to the blue light’s effect, plant phenotypic responses were investigated in wild type Arabidopsis (Col-0), and its quintuple phytochrome ( phyA phyB phyC phyD phyE ) mutant plants under the following light treatments: (1) R, a pure red light from 660-nm LED; (2) B, a pure blue light from 455-nm LED; (3) BR, a impure blue light from LED combination of 94% B and 6% R; and (4) BRF, another impure blue light from LED combination of BR and 6 µmol m −2 s −1 of FR (735 nm). For all the light treatments, a photosynthetic photon flux density of ≈100 μmol m −2 s −1 were provided by 24-h lighting daily inside a walk-in growth chamber, which had an air temperature of ≈ 23 °C. The calculated phytochrome photoequilibrium was 0.89, 0.50, 0.69, and 0.60 for R, B, BR, and BRF, respectively, indicating a higher phytochrome activity under R and BR than B and BRF. After 18 days of light treatment, B or BRF increased main stem length in wild-type plants compared with R, but BR had an inhibition effect similar to R. Also, B and BRF relative to R or BR induced earlier flowering and reduced leaf size in wild type plants, showing typical shade-avoidance responses. In phytochrome-deficient mutant plants, the above shade-avoidance responses were inhibited under B or BRF, and induced under BR. However, as an exception, hypocotyl length, a growth trait during the de-etiolation stage, was reduced under B, BR and BRF vs. R regardless of phytochrome absence. It suggests that for mature Arabidopsis plants, phytochrome plays an active role in blue-light-mediated stem elongation and associated shade-avoidance response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,728
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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