Lower methane emissions were associated with higher abundance of ruminal Prevotella in a cohort of Colombian buffalos
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Ruminants burp massive amounts of methane into the atmosphere and significantly contribute to the deposition of greenhouse gases and the consequent global warming. It is therefore urgent to devise strategies to mitigate ruminant's methane emissions to alleviate climate change. Ruminal methanogenesis is accomplished by a series of methanogen archaea in the phylum Euryarchaeota, which piggyback into carbohydrate fermentation by utilizing residual hydrogen to produce methane. Abundance of methanogens, therefore, is expected to affect methane production. Furthermore, availability of hydrogen produced by cellulolytic bacteria acting upstream of methanogens is a rate-limiting factor for methane production. The aim of our study was to identify microbes associated with the production of methane which would constitute the basis for the design of mitigation strategies. RESULTS: Moderate differences in the abundance of methanogens were observed between groups. In addition, we present three lines of evidence suggesting an apparent higher abundance of a consortium of Prevotella species in animals with lower methane emissions. First, taxonomic classification revealed increased abundance of at least 29 species of Prevotella. Second, metagenome assembly identified increased abundance of Prevotella ruminicola and another species of Prevotella. Third, metabolic profiling of predicted proteins uncovered 25 enzymes with homology to Prevotella proteins more abundant in the low methane emissions group. CONCLUSIONS: We propose that higher abundance of ruminal Prevotella increases the production of propionic acid and, in doing so, reduces the amount of hydrogen available for methanogenesis. However, further experimentation is required to ascertain the role of Prevotella on methane production and its potential to act as a methane production mitigator.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».