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Enregistrement W3109440604 · doi:10.1001/jama.2020.21566

Association of Hemochromatosis <i>HFE</i> p.C282Y Homozygosity With Hepatic Malignancy

2020· article· en· W3109440604 sur OpenAlexaff
Janice L. Atkins, Luke C. Pilling, Jane Masoli, Chia‐Ling Kuo, Jeremy D. Shearman, Paul C. Adams, David Melzer

Notice bibliographique

RevueJAMA · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésMedicineHemochromatosisHereditary hemochromatosisDeath certificateInterquartile rangeInternal medicineCohortIncidence (geometry)PopulationCancer registryCohort studyCause of deathCancerDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: Hereditary hemochromatosis is predominantly caused by the HFE p.C282Y homozygous pathogenic variant. Liver carcinoma and mortality risks are increased in individuals with clinically diagnosed hereditary hemochromatosis, but risks are unclear in mostly undiagnosed p.C282Y homozygotes identified in community genotyping. Objective: To estimate the incidence of primary hepatic carcinoma and death by HFE variant status. Design, Setting, and Participants: Cohort study of 451 186 UK Biobank participants of European ancestry (aged 40-70 years), followed up from baseline assessment (2006-2010) until January 2018. Exposures: Men and women with HFE p.C282Y and p.H63D genotypes compared with those with neither HFE variants. Main Outcomes and Measures: Two linked co-primary outcomes (incident primary liver carcinoma and death from any cause) were ascertained from follow-up via hospital inpatient records, national cancer registry, and death certificate records, and from primary care data among a subset of participants for whom data were available. Associations between genotype and outcomes were tested using Cox regression adjusted for age, assessment center, genotyping array, and population genetics substructure. Kaplan-Meier lifetable probabilities of incident diagnoses were estimated from age 40 to 75 years by HFE genotype and sex. Results: A total of 451 186 participants (mean [SD] age, 56.8 [8.0] years; 54.3% women) were followed up for a median (interquartile range) of 8.9 (8.3-9.5) years. Among the 1294 male p.C282Y homozygotes, there were 21 incident hepatic malignancies, 10 of which were in participants without a diagnosis of hemochromatosis at baseline. p.C282Y homozygous men had a higher risk of hepatic malignancies (hazard ratio [HR], 10.5 [95% CI, 6.6-16.7]; P < .001) and all-cause mortality (n = 88; HR, 1.2 [95% CI, 1.0-1.5]; P = .046) compared with men with neither HFE variant. In lifetables projections for male p.C282Y homozygotes to age 75 years, the risk of primary hepatic malignancy was 7.2% (95% CI, 3.9%-13.1%), compared with 0.6% (95% CI, 0.4%-0.7%) for men with neither variant, and the risk of death was 19.5% (95% CI, 15.8%-24.0%), compared with 15.1% (95% CI, 14.7%-15.5%) among men with neither variant. Among female p.C282Y homozygotes (n = 1596), there were 3 incident hepatic malignancies and 60 deaths, but the associations between homozygosity and hepatic malignancy (HR, 2.1 [95% CI, 0.7-6.5]; P = .22) and death (HR, 1.2 [95% CI, 0.9-1.5]; P = .20) were not statistically significant. Conclusions and Relevance: Among men with HFE p.C282Y homozygosity, there was a significantly increased risk of incident primary hepatic malignancy and death compared with men without p.C282Y or p.H63D variants; there was not a significant association for women. Further research is needed to understand the effects of early diagnosis and treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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