Mapping of Ug99 stem rust resistance in Canadian durum wheat
Notice bibliographique
Résumé
Stem rust, caused by Puccinia graminis f. sp. tritici (Pgt), has potential to cause major yield losses in durum wheat. Development of durum cultivars with improved resistance to stem rust is a sustainable option for effective control of this disease. This study was conducted to identify genomic regions associated with resistance to Ug99-derived Pgt races using a doubled haploid (DH) mapping population produced from a cross between the resistant experimental line A9919-BY5C and the moderately susceptible cultivar ‘Strongfield’. The parents and DH lines were phenotyped for adult plant disease severity and infection response at Njoro, Kenya, for four years, and for seedling reaction to race TTKSK in a containment facility near Morden, Canada. Composite interval mapping using 612 SNP and DArT markers indicated four significant QTL for resistance to stem rust on chromosomes 1B, 4A, 5B, and 6A. A major and stable QTL from A9919-BY5C was identified on the short arm of chromosome 6A (6AS), which accounted for 71% of variation explained for seedling resistance and up to 46% for field resistance. This QTL mapped near the Sr8 locus and may be Sr8155B1, or a novel gene at the same location. Another QTL for adult plant resistance from A9919-BY5C was mapped on chromosome 1B that explained up to 14% of the phenotypic variation and likely is Sr14. Two minor QTL were identified in ‘Strongfield’ on chromosomes 4A and 5B that were inconsistent over years. Markers associated with the 6AS and 1B QTL can be used to proactively stack resistance to Ug99-derived races of Pgt into Canadian durum wheat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».