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Enregistrement W3109555147 · doi:10.1093/hmg/ddaa258

Heterozygous loss of <i>WBP11</i> function causes multiple congenital defects in humans and mice

2020· article· en· W3109555147 sur OpenAlexaff
Ella MMA Martin, Annabelle Enriquez, Duncan B. Sparrow, David T. Humphreys, Aideen McInerney‐Leo, Paul Leo, Emma L. Duncan, Kavitha R. Iyer, Joelene A Greasby, Eddie Ip, Eleni Giannoulatou, Delicia Z Sheng, Elizabeth Wohler, Clémantine Dimartino, Jeanne Amiel, Yline Capri, Daphné Lehalle, Adi Mory, Yael Wilnai, Yael Lebenthal, Ali G. Gharavi, Grażyna Krzemien, Monika Miklaszewska, Robert D. Steiner, Cathy Raggio, Robert D. Blank, Hagit Baris Feldman, Hila Milo Rasouly, Nara L. M. Sobreira, Rebekah Jobling, Christopher T. Gordon, Philip F. Giampietro, Sally L. Dunwoodie, Gavin Chapman

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Human Genome Research InstituteNational Health and Medical Research CouncilNew South Wales GovernmentNational Institutes of HealthEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentAgence Nationale de la RechercheBaylor-Hopkins Center for Mendelian Genomics
Mots-clésBiologyNull alleleHaploinsufficiencyLoss functionHeterozygote advantageGeneticsMissense mutationAlleleMutationGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genetic causes of multiple congenital anomalies are incompletely understood. Here, we report novel heterozygous predicted loss-of-function (LoF) and predicted damaging missense variants in the WW domain binding protein 11 (WBP11) gene in seven unrelated families with a variety of overlapping congenital malformations, including cardiac, vertebral, tracheo-esophageal, renal and limb defects. WBP11 encodes a component of the spliceosome with the ability to activate pre-messenger RNA splicing. We generated a Wbp11 null allele in mouse using CRISPR-Cas9 targeting. Wbp11 homozygous null embryos die prior to E8.5, indicating that Wbp11 is essential for development. Fewer Wbp11 heterozygous null mice are found than expected due to embryonic and postnatal death. Importantly, Wbp11 heterozygous null mice are small and exhibit defects in axial skeleton, kidneys and esophagus, similar to the affected individuals, supporting the role of WBP11 haploinsufficiency in the development of congenital malformations in humans. LoF WBP11 variants should be considered as a possible cause of VACTERL association as well as isolated Klippel-Feil syndrome, renal agenesis or esophageal atresia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,645

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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