MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3109625190 · doi:10.1158/2643-3249.lymphoma20-po-40

Abstract PO-40: FOXO1 mutations mimic positive selection signals to promote germinal center B-cell expansion and lymphomagenesis

2020· article· en· W3109625190 sur OpenAlexaff
Mark P. Roberto, Gabriele Varano, Rosa Viñas-Castells, Antony B. Holmes, Rahul Kumar, Pedro Farinha, David W. Scott, David Dominguez-Sola

Notice bibliographique

RevueBlood Cancer Discovery · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFOXO transcription factor regulation
Établissements canadiensSpinal Cord Injury BC
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGerminal centerFOXO1B cellBiologyCancer researchCancerPI3K/AKT/mTOR pathwayLymphomaTranscription factorMutantGeneGeneticsSignal transductionImmunologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The transcription factor FOXO1 directs germinal center (GC) polarity and supports affinity maturation by modulating immune activation programs in GC B cells. Recurrent somatic mutations targeting FOXO1 in GC-derived B-cell non-Hodgkin lymphomas (B-NHL) are thought to disrupt its negative regulation by PI3K and function as gain-of-function, constitutively active alleles. Herein, we demonstrate that B-NHL FOXO1 mutants are instead hypomorphic alleles encoding proteins with altered transcriptional activities. Analysis of Foxo1 mutant mouse models, engineered cell lines, and primary samples shows that B-NHL FOXO1 mutations induce simultaneous hyperactivation of Stress Activated Protein Kinase -SAPK/JNK and Phosphoinositide 3-kinase -PI3K/AKT signaling pathways and gene expression programs characteristic of GC B cells undergoing positive selection. These alterations confer mutant B cells with a competitive advantage in response to key immune signals, leading to abnormal amplification of GC responses. Moreover, we find that FOXO1 mutant-driven transcriptional programs are prevalent in human B-NHL and predict poor clinical outcomes. These results imply the frequent co-option of GC positive selection programs in the pathogenesis of GC-derived lymphomas. Citation Format: Mark P. Roberto, Gabriele Varano, Rosa Viñas-Castells, Antony B. Holmes, Rahul Kumar, Pedro Farinha, David W. Scott, David Dominguez-Sola. FOXO1 mutations mimic positive selection signals to promote germinal center B-cell expansion and lymphomagenesis [abstract]. In: Proceedings of the AACR Virtual Meeting: Advances in Malignant Lymphoma; 2020 Aug 17-19. Philadelphia (PA): AACR; Blood Cancer Discov 2020;1(3_Suppl):Abstract nr PO-40.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBlood Cancer DiscoveryMême sujetFOXO transcription factor regulationTravaux en français237 207