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Enregistrement W3109625820 · doi:10.3390/insects11110820

Transcriptomics-Based Approach Identifies Spinosad-Associated Targets in the Colorado Potato Beetle, Leptinotarsa decemlineata

2020· article· en· W3109625820 sur OpenAlexafffund
Pierre Bastarache, Gabriel Wajnberg, Pascal Dumas, Simi Chacko, Jacynthe Lacroix, Nicolas Crapoulet, Chandra E. Moffat, Pier Morin

Notice bibliographique

RevueInsects · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaAtlantic Cancer Research InstituteUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNew Brunswick Innovation Foundation
Mots-clésColorado potato beetleSpinosadLeptinotarsaBiologyImidaclopridPEST analysisBiopesticidePest controlBiotechnologyPesticideToxicologyAgronomyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

is an insect pest that threatens potato crops globally. The primary method to control its damage on potato plants is the use of insecticides, including imidacloprid, chlorantraniliprole and spinosad. However, insecticide resistance has been frequently observed in Colorado potato beetles. The molecular targets and the basis of resistance to imidacloprid and chlorantraniliprole have both been previously quantified. This work was undertaken with the overarching goal of better characterizing the molecular changes associated with spinosad exposure in this insect pest. Next-generation sequencing was conducted to identify transcripts that were differentially expressed between Colorado potato beetles exposed to spinosad versus control insects. Results showed several transcripts that exhibit different expression levels between the two conditions, including ones coding for venom carboxylesterase-6, chitinase 10, juvenile hormone esterase and multidrug resistance-associated protein 4. In addition, several microRNAs, such as miR-12-3p and miR-750-3p, were also modulated in the investigated conditions. Overall, this work reveals a molecular footprint underlying spinosad response in Colorado potato beetles and provides novel leads that could be targeted as part of RNAi-based approaches to control this insect pest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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