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Enregistrement W3109651634 · doi:10.3389/fpls.2020.554158

Postharvest Properties of Ultra-Late Maturing Peach Cultivars and Their Attributions to Melting Flesh (M) Locus: Re-evaluation of M Locus in Association With Flesh Texture

2020· article· en· W3109651634 sur OpenAlexfundno aff
Ryohei Nakano, Takashi Kawai, Yosuke Fukamatsu, Kagari Akita, Sakine Watanabe, Takahiro Asano, Daisuke Takata, Mamoru Sato, Fumio Fukuda, Koichiro Ushijima

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePostharvest Quality and Shelf Life Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésFleshPostharvestBiologyLocus (genetics)CultivarSofteningHaplotypeEthyleneHorticultureGeneGeneticsBotanyGenotypeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The postharvest properties of two ultra-late maturing peach cultivars, “Tobihaku” (TH) and “Daijumitsuto” (DJ), were investigated. Fruit were harvested at commercial maturity and held at 25°C. TH exhibited the characteristics of normal melting flesh (MF) peach, including rapid fruit softening associated with appropriate level of endogenous ethylene production In contrast, DJ did not soften at all during 3 weeks experimental period even though considerable ethylene production was observed. Fruit of TH and DJ were treated with 5,000 ppm of propylene, an ethylene analog, continuously for 7 days. TH softened rapidly whereas DJ maintained high flesh firmness in spite of an increase in endogenous ethylene production, suggesting that DJ but not TH lacked the ability to be softened in response to endogenous and exogenous ethylene/propylene. DNA-seq analysis showed that tandem endo-polygalacturonase ( endoPG ) genes located at melting flesh (M) locus, Pp-endoPGM ( PGM ), and Pp-endoPGF ( PGF ), were deleted in DJ. The endoPG genes at M locus are known to control flesh texture of peach fruit, and it was suggested that the non-softening property of DJ is due to the lack of endoPG genes. On the other hand, TH possessed an unidentified M haplotype that is involved in determination of MF phenotype. Structural identification of the unknown M haplotype, designated as M 0 , through comparison with previously reported M haplotypes revealed distinct differences between PGM on M 0 haplotype ( PGM-M 0 ) and PGM on other haplotypes ( PGM-M 1 ). Peach M haplotypes were classified into four main haplotypes: M 0 with PGM-M 0 ; M 1 with both PGM-M 1 and PGF ; M 2 with PGM-M 1 ; and M 3 lacking both PGM and PGF . Re-evaluation of M locus in association with MF/non-melting flesh (NMF) phenotypes in more than 400 accessions by using whole genome shotgun sequencing data on database and/or by PCR genotyping demonstrated that M 0 haplotype was the common haplotype in MF accessions, and M 0 and M 1 haplotypes were dominant over M 2 and M 3 haplotypes and co-dominantly determined the MF trait. It was also assumed on the basis of structural comparison of M haplotypes among Prunus species that the ancestral haplotype of M 0 diverged from those of the other haplotypes before the speciation of Prunus persica .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,290
Score d'incertitude au seuil0,206

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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