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Enregistrement W3109714884 · doi:10.1101/2020.12.04.412569

A First-in-class, Highly Selective and Cell-active Allosteric Inhibitor of Protein Arginine Methyltransferase 6 (PRMT6)

2020· preprint· en· W3109714884 sur OpenAlexafffund
Yudao Shen, Fengling Li, Magdalena M. Szewczyk, Levon Halebelian, Irene Chau, Mohammad S. Eram, Carlo dela Seña, Kwang‐Su Park, Fanye Meng, He Chen, Hong Zeng, David McLeod, Carlos Zepeda‐Velázquez, Robert M. Campbell, Mary M. Mader, Brian M. Watson, Matthieu Schapira, C.H. Arrowsmith, Rima Al‐awar, Dalia Baršytė-Lovejoy, H. Ümit Kanıskan, Peter J. Brown, Masoud Vedadi, Jian Jin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesOntario GenomicsNational Institutes of HealthOntario Ministry of Research, Innovation and ScienceFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaEli Lilly and CompanyIcahn School of Medicine at Mount SinaiPfizerNovartis PharmaOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaA
Mots-clésAllosteric regulationMethyltransferaseChemistryAllosteric modulatorEnzymeEnantiomerArginineEpigeneticsBiochemistryMethylationStereochemistryAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract PRMT6 catalyzes monomethylation and asymmetric dimethylation of arginine residues in various proteins, plays important roles in biological processes and is associated with multiple cancers. While there are several reported PRMT6 inhibitors, a highly selective PRMT6 inhibitor has not been reported to date. Furthermore, allosteric inhibitors of protein methyltransferases are rare. Here we report the discovery and characterization of a first-in-class, highly selective allosteric inhibitor of PRMT6, SGC6870. SGC6870 is a potent PRMT6 inhibitor (IC 50 = 77 ± 6 nM) with outstanding selectivity for PRMT6 over a broad panel of other methyltransferases and non-epigenetic targets. Notably, the crystal structure of the PRMT6–SGC6870 complex and kinetic studies revealed SGC6870 binds a unique, induced allosteric pocket. Additionally, SGC6870 engages PRMT6 and potently inhibits its methyltransferase activity in cells. Moreover, SGC6870’s enantiomer, SGC6870N, is inactive against PRMT6 and can be utilized as a negative control. Collectively, SGC6870 is a well-characterized PRMT6 chemical probe and valuable tool for further investigating PRMT6 functions in health and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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