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Enregistrement W3109754543 · doi:10.1101/2020.11.25.20233163

Clonal hematopoiesis is associated with risk of severe Covid-19

2020· preprint· en· W3109754543 sur OpenAlexaff
Kelly L. Bolton, Youngil Koh, Michael B. Foote, Hogune Im, Justin Jee, Choong Hyun Sun, Anton Safonov, Ryan Ptashkin, Joon Ho Moon, Ji Yeon Lee, Jongtak Jung, Chang Kyung Kang, Kyoung‐Ho Song, Pyeong Gyun Choe, Wan Beom Park, Hong Bin Kim, Myoung‐don Oh, Han Song, Sugyeong Kim, Minal Patel, Andriy Derkach, Erika Gedvilaite, Kaitlyn Tkachuk, Lior Z. Braunstein, Teng Gao, Elli Papaemmanuil, N. Esther Babady, Melissa S. Pessin, Mini Kamboj, Luis A. Díaz, Marc Ladanyi, Michael J. Rauh, Pradeep Natarajan, Mitchell J. Machiela, Philip Awadalla, Joseph Vijai, Kenneth Offit, Larry Norton, Michael F. Berger, Ross L. Levine, Eu Suk Kim, Nam Joong Kim, Ahmet Zehir

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchQueen's University
Organismes subventionnairesGreat Southern Development Commission, Government of Western AustraliaNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthStand Up To CancerKorea Research Environment Open NetworkKorea Health Industry Development InstituteKorea Institute of Science and Technology InformationCycle for SurvivalKorea Institute of Science and TechnologyMemorial Sloan-Kettering Cancer Center
Mots-clésHaematopoiesisCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Internal medicineMedicineDiseaseImmunologyStem cellBiologyInfectious disease (medical specialty)Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Acquired somatic mutations in hematopoietic stem and progenitor cells (clonal hematopoiesis or CH) are associated with advanced age, increased risk of cardiovascular and malignant diseases, and decreased overall survival. 1–4 These adverse sequelae may be mediated by altered inflammatory profiles observed in patients with CH. 2,5,6 A pro-inflammatory immunologic profile is also associated with worse outcomes of certain infections, including SARS-CoV-2 and its associated disease Covid-19. 7,8 Whether CH predisposes to severe Covid-19 or other infections is unknown. Among 515 individuals with Covid-19 from Memorial Sloan Kettering (MSK) and the Korean Clonal Hematopoiesis (KoCH) consortia, we found that CH was associated with severe Covid-19 outcomes (OR=1.9, 95%=1.2-2.9, p=0.01). We further explored the relationship between CH and risk of other infections in 14,211 solid tumor patients at MSK. CH was significantly associated with risk of Clostridium Difficile (HR=2.0, 95% CI: 1.2-3.3, p=6×10 −3 ) and Streptococcus/Enterococcus infections (HR=1.5, 95% CI=1.1-2.1, p=5×10 −3 ). These findings suggest a relationship between CH and risk of severe infections that warrants further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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