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Enregistrement W3110339206 · doi:10.1093/jas/skaa278.554

PSIX-32 Assessment of Mucosa-associated Microbiota in the Colon and Rumen of Dairy Calves Fed High Plane of Milk and during Weaning Transition

2020· article· en· W3110339206 sur OpenAlexaff
Wei Guo, J.K. van Niekerk, Mi Zhou, M.A. Steele

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRumenPrevotellaBiologyWeaningAnimal scienceLarge intestineDry matterButyric acidFermentationFood scienceBacteriaBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The nature of weaning is considered as the most stressful period experienced by dairy calves and has been known to negatively affect calf growth and intake. The objectives of this study were to investigate the shift of rumen and colon mucosa-associated microbiota in dairy calves fed with a high plane of milk pre- and post-weaning, and whether such shifts are associated with rumen fermentation and growth performance. Six Holstein dairy bull calves were ruminally cannulated at the second week of life followed by weaning at the end of week 6. Ruminal and colon tissue samples were biopsied at the end of week 5, 7 and 12 to determine the bacterial community changes, and rumen content was collected at the same time to measure rumen fermentation parameters. QIIME2 was used to analyze microbial profiles and R studio software was used to determine the microbial changes and its relationship with phenotypic measures. Age-dependent profiles were observed for the colon mucosa associated microbiota but not for rumen mucosa associated microbiota, indicating that varied responses to weaning transition exists between colon and rumen mucosa associated microbiota. As calves aged, higher abundance of taxa such as Delftia (associated with hexadecanoic acid production) and lower abundance of Veillonella (associated with short-chain organic acids utilization) were detected in the colon mucosa. The rumen also displayed taxonomic changes with decreases in Pseudobutyrivibrio in older calves. In addition, we identified significantly positive correlations between Prevotella associated with rumen mucosa and average daily gain, Isovalerate and Isobutyrate, suggesting that this genus may promote rumen fermentation during weaning transition. Our findings suggest that weaning transition affects rumen and colon mucosa-associated bacteria, and some of the rumen mucosa-associated microbiota promote rumen fermentation during this period, which may have long-term effects on animal health and productivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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