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Enregistrement W3110352068 · doi:10.1186/s13362-020-00096-y

Quantifying the shift in social contact patterns in response to non-pharmaceutical interventions

2020· article· en· W3110352068 sur OpenAlexafffundabout
Zachary McCarthy, Yanyu Xiao, Francesca Scarabel, Biao Tang, Nicola Luigi Bragazzi, Kyeongah Nah, Jane M. Heffernan, Ali Asgary, V. Kumar Murty, Nicholas H. Ogden

Notice bibliographique

RevueJournal of Mathematics in Industry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaFields Institute for Research in Mathematical SciencesUniversity of TorontoYork University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésSocial distancePsychological interventionPandemicPublic healthMixing patternsTransmission (telecommunications)Environmental healthMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Mixing (physics)Infectious disease (medical specialty)Computer scienceDiseaseNursing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Social contact mixing plays a critical role in influencing the transmission routes of infectious diseases. Moreover, quantifying social contact mixing patterns and their variations in a rapidly evolving pandemic intervened by changing public health measures is key for retroactive evaluation and proactive assessment of the effectiveness of different age- and setting-specific interventions. Contact mixing patterns have been used to inform COVID-19 pandemic public health decision-making; but a rigorously justified methodology to identify setting-specific contact mixing patterns and their variations in a rapidly developing pandemic, which can be informed by readily available data, is in great demand and has not yet been established. Here we fill in this critical gap by developing and utilizing a novel methodology, integrating social contact patterns derived from empirical data with a disease transmission model, that enables the usage of age-stratified incidence data to infer age-specific susceptibility, daily contact mixing patterns in workplace, household, school and community settings; and transmission acquired in these settings under different physical distancing measures. We demonstrated the utility of this methodology by performing an analysis of the COVID-19 epidemic in Ontario, Canada. We quantified the age- and setting (household, workplace, community, and school)-specific mixing patterns and their evolution during the escalation of public health interventions in Ontario, Canada. We estimated a reduction in the average individual contact rate from 12.27 to 6.58 contacts per day, with an increase in household contacts, following the implementation of control measures. We also estimated increasing trends by age in both the susceptibility to infection by SARS-CoV-2 and the proportion of symptomatic individuals diagnosed. Inferring the age- and setting-specific social contact mixing and key age-stratified epidemiological parameters, in the presence of evolving control measures, is critical to inform decision- and policy-making for the current COVID-19 pandemic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,627
Tête enseignante GPT0,548
Écart entre enseignants0,079 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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