PSIII-10 The association of genes involved in mitochondrial function with growth, size, and feed efficiency traits in developing beef heifers
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The objective was to determine if genetic markers related to mitochondrial function are associated with growth and feed intake of Bos taurus heifers fed forage-based diets. Weight data collected at birth, weaning, and as yearlings were available on 373 heifers. As yearlings, feed intake was measured using an Insentec system. Primary ancestral breeds of heifers included 204 British, 66 Continental European, 68 American Aberdeen, 29 British mix, and 6 American Aberdeen mix. Traits included DMI, ADG, G:F, adjusted birth weight (BWT), adjusted 205 weaning weight (WW), and average of start and end feed trial weight (FWT) and body volume (VOL). Heifers were genotyped using Neogen GGP150HD for beef cattle. Markers (n=56) were extracted if located within or flanking AMPK, PPARGC1A, FGF2, and SIRT1 or on mitochondrial DNA using ARS-UCD1.2 coordinates. After quality checks (minor allele frequency and call rate), 44 markers remained. No mitochondrial markers passed quality checks. For each trait, each marker was fit independently as a fixed effect in a model including year and group based on frame score (n=4), ancestry (n=5), and dam age (n=4; non-adjusted traits only). Pairwise comparisons were done using Tukey-Kramer method. No markers within FGF2 or SIRT1 had significant associations. Two markers were found significant for PPARGC1A, where Hapmap24121-BTC-039009 (P=0.0344) showed the C allele increased DMI. For weight traits, significant markers surrounding AMPK and within PPARGC1A (n=5; 0.0009≤P≤ 0.0468) identified dominance gene actions that indicate certain variants of the AMPK and PPARGC1A increased weight across time-points. For VOL, 16 of 22 markers within PPARGC1A were significant (0.0068≤P≤0.0467). Of the 16 markers, 14 identified a recessive variant that increased volume, but did not translate to increased weight. Further research is needed to better understand the roles that genetic markers for AMPK and PPARGC1A have on tissue level mitochondrial function and energy metabolism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».