MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3110586611 · doi:10.1093/jas/skaa054.163

257 Young Scholar Presentation: Using an integrated systems biology platform to determine the mode of action of feed additives in nursery pig diets

2020· article· en· W3110586611 sur OpenAlexaff
Michaela P. Trudeau, Huyen Tran, Brenda de Rodas, T.P. Karnezos, Andrés Gómez, Chi Chen, Pedro E Urriola, G. C. Shurson

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensAgribrands Purina (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetabolomicsBiologyWeaningAntibioticsChlortetracyclineFood scienceMicrobiomeMetaboliteMetabolomeGut floraIleumFeed additiveAnimal scienceBiochemistryBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The mechanisms of action for antibiotic growth promotion are poorly understood, making it difficult to select effective alternatives that are capable of providing similar responses. In order to evaluate the complete impact of supplementing antibiotics and other feed additives to nursery pigs, an integrated systems biology platform encompasses the merging of traditional nutrition models with gut physiology, nutrition and omics technologies. The objective of this study was to evaluate the growth response, metabolic responses, and intestinal microbiome composition of nursery pigs fed antibiotics. Antibiotic diets containing chlortetracycline and sulfamethazine (AB), and diets containing no antibiotics (CON) were fed in 3 trials. Pigs were weighed at d 10, 21, and 42 post-weaning and ADG, ADFI, and G:F was calculated. On d 42, one pig/pen was selected for blood, cecal, and ileum content collection to assess metabolomic profiles via liquid chromatography-mass spectrometry. The composition of bacterial communities in those samples was determined by sequencing the V4 region of the 16s rRNA bacterial gene in the MiSeq platform. Metabolomics and microbiome data were analyzed using multivariate approaches and growth performance data were analyzed using a generalized mixed model. Pigs fed AB were heavier (P < 0.05) on day 42. There were also significant differences (P < 0.05) in the cecal and serum metabolite profile of pigs fed AB compared with CON. However, there were no changes in bile acid or short chain fatty acid concentrations in cecal samples when feeding AB. Although AB had no effect on alpha or beta microbiome diversity, the abundance of specific bacterial taxa shifted significantly (P < 0.05). These findings suggest that feeding antibiotics improve growth, alter metabolism, and affect the abundance of specific taxonomic groups of bacteria in the gut. In the future, this approach will be utilized to evaluate antibiotic alternatives for nursery pigs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,171
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1710,035

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Animal Science→Même sujetGut microbiota and health→Travaux en français237 207→