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Enregistrement W3110711573 · doi:10.1111/mec.15768

The tip of the iceberg: Genome wide marker analysis reveals hidden hybridization during invasion

2020· article· en· W3110711573 sur OpenAlexaff
Hanna S. Rosinger, Armando Geraldes, Kristin A. Nurkowski, Paul Battlay, Roger Cousens, Loren H. Rieseberg, Kathryn A. Hodgins

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Ecology and Taxonomy Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCentre of Excellence in Cognition and its Disorders, Australian Research Council
Mots-clésIntrogressionBiologyHybridHybrid zoneBiodiversityEvolutionary biologyRange (aeronautics)EcologyZoologyGene flowGenetic variationGeneticsBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biological invasions are accelerating, and invasive species can have large economic impacts as well as severe consequences for biodiversity. During invasions, species can interact, potentially resulting in hybridization. Here, we examined two Cakile species, C. edentula and C. maritima (Brassicaceae), that co-occur and may hybridize during range expansion in separate regions of the globe. Cakile edentula invaded each location first, while C. maritima established later, apparently replacing the former. We assessed the evidence for hybridization in western North America and Australia, where both species have been introduced, and identified source populations with 4561 SNPs using Genotype-by-Sequencing. Our results indicate that C. edentula in Australia originated from one region of eastern North America while in western North America it is probably from multiple sources. Cakile maritima in Australia is derived from at least two different parts of Europe while the introduction in western North America is from one. Although morphological evidence of hybridization is generally limited to mixed species populations in Australia and virtually absent elsewhere, our genetic analysis revealed relatively high levels of hybridization in Australia (58% hybrids using Admixture) and supported the presence of hybrids in western North America (16% hybrids using Admixture) and New Zealand. Hybrids might be commonly overlooked in invaders, as identification based solely on morphological traits may represent only the tip of the iceberg. Our study reveals a repeated pattern of invasion, hybridization and apparent replacement of one species by another, which offers an opportunity to investigate the role of hybridization and introgression during invasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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